Есть ли вич в иране
Эксперты Международной сети снижения вреда в Ливерпуле изучили опыт заместительной терапии и обмена шприцев в Иране, который может стать примером для других стран, в том числе на Западе, пишет Associated Press. Находясь рядом с полями опиумного мака Афганистана, Иран уже давно борется с большим количеством наркопотребителей. Когда ВИЧ-инфекция появилась в Иране, вирус первым затронул потребителей героина. Чтобы сдержать вспышку и не допустить распространения заболевания среди населения в целом, иранские лидеры приняли подход, который оказался удивительно прогрессивным для авторитарного режима.
"Это можно рассматривать как социально либеральные меры, но с точки зрения общественного здравоохранения это просто прагматизм", - сказала Жумана Эрме (Joumana Hermez), специалист по СПИДу Каирского офиса Всемирной организации здравоохранения. Эрме и другие эксперты на конференции рассказали о мерах, принимаемых на Ближнем Востоке в связи с эпидемией СПИДа.
На протяжении многих лет Иран проводит жесткую антинаркотическую политику, там по-прежнему казнят людей за некоторые преступления, связанные с незаконным оборотом наркотиков. По мнению экспертов, сдвиг в ситуации наметился около десяти лет назад, когда врачи и ученые сумели убедить религиозных и государственных лидеров, что если они не помогут потребителям наркотиков справиться с зависимостью, Иран столкнется с гораздо более масштабной эпидемией СПИДа.
"Они начали понимать, что лучше иметь проблемы с наркозависимостью, чем проблемы с наркозависимостью и с ВИЧ", - отметил доктор Саид Рамин Радфар (Seyed Ramin Radfar), исполнительный директор иранской неправительственной организации, которая реализует проекты обмена шприцев и заместительной терапии метадоном в стране [на фото, - прим. AIDS.ru]. Религиозные лидеры издали фетву, гласящую, что потребители наркотиков не должны подвергаться судебному преследованию, если они обратились за помощью.
В 2005 году верховный судья Ирана постановил, что инициативы по борьбе с распространением ВИЧ-инфекции направлены на защиту общества и не должны быть заблокированы. Это привело к изменению в отношении к наркопотребителям. "Если наркопотребители соглашались на лечение, то к ним относились как к пациентам, а не как к преступникам", - сказал Радфар.
Изначально чистые шприцы и терапию метадоном начали оказывать потребителям наркотиков в иранских тюрьмах, где наркозависимость процветает. Когда эти программы только начали функционировать, власть поняла, что освобожденным заключенным некуда было обратиться, чтобы продолжить лечение. После этого правительство создало более 200 государственных клиник, а так же были открыты более 1000 частных клиник, которые предоставляли лечение метадоном. Даже в таких странах, как Австралия, Канада и США, заключенным сложно получить метадон или стерильные шприцы. До недавнего времени США отказывались финансировать программы по обмену шприцев, в рамках которых наркопотребители получают чистые шприцы в обмен на использованные.
"Иран - это, безусловно, модель для всего мира, в некоторых отношениях", - сказала Саси Маклин (Susie McLean), старший консультант по вопросам ВИЧ и наркозависимости из Международного альянса по СПИДу. "Никто никогда бы не подумал, что они сделают предоставление услуг "торчкам" приоритетом". Тем не менее, Маклин отметила, что страна еще далека от совершенства, и инициативы по-прежнему нуждаются в расширении до гораздо больших масштабов. Есть также отдельные проблемы с поставкой метадона, а сервисные службы иногда распределяться по стране неравномерно.
Хотя чиновники по-прежнему проводят исследования, чтобы выяснить, сколько людей в Иране имеют ВИЧ, они заявляют, что политика страны, вероятно, значительно сократила передачу вируса. Тем не менее, количество ВИЧ-положительных растет, и в 2008 году, по оценкам министерства здравоохранения, в Иране было от 70 тысяч до 100 тысяч человек с ВИЧ. Учитывая, что все больше случаев ВИЧ в настоящее время появляется не среди потребителей наркотиков, эксперты говорят, что настало время для борьбы с ВИЧ-инфекцией в других уязвимых группах населения - среди геев и секс-работников. Пока Иран не предпринимает попыток защитить их, и гомосексуальность, супружеская неверность и проституция остаются незаконными. Презервативы распространяются в тюрьме, но только для супружеских свиданий. Президент Махмуд Ахмадинежад (Mahmoud Ahmadinejad) заявил, что в стране нет геев, и соответственно нет инициатив по СПИДу, ориентированных на мужчин-геев или секс-работников. Если Иран намерен остановить эпидемию СПИДа, это может стать преградой.
"Многое из происходящего в Иране неоднозначно, но это, судя по всему, не мешает им бороться с распространением ВИЧ", - заметил Джерри Стимсон (Gerry Stimson), исполнительный директор Международной сети снижения вреда. Стимсон посетил клинику заместительной терапии, которая находится в иранской тюрьме недалеко от Тегерана. Он был впечатлен чистотой тюрьмы, иранскими коврами и бесплатными презервативами, но признал, что ему, вероятно, показали самые лучшие помещения. "Они добились хорошего прогресса в том, чего мы никогда от них не ожидали", - сказал Стимсон. "Но я все равно не хотел бы оказаться в иранской тюрьме".
КОРОНАВИРУС В ИРАНЕ: ЧТО РАССКАЗЫВАЮТ ВРАЧИ И ЧТО СКРЫВАЮТ ВЛАСТИ
Иран столкнулся с одной из крупнейших вспышек коронавируса в мире. В пятницу жители страны в семейном кругу отмечали Новруз - персидский Новый год, но настроение было совсем не праздничное.
Люди опасаются, что правительство скрывает истинный масштаб распространения вируса и что ситуация с Covid-19 может стремительно ухудшиться.
Мохаммад без устали работает с первых дней вспышки коронавируса, спасая жизни своих пациентов. Он - врач в больнице в провинции Гилан на севере Ирана. Мохаммад не видел свою семью 14 дней. Он потерял нескольких друзей и коллег - в том числе бывшего наставника, профессора медицинского института, который недавно скончался от коронавируса."Такое происходит не только в нашей больнице. Вспышка коронавируса парализовала всю нашу систему здравоохранения", - говорит Мохаммад. "Моральный дух сотрудников очень низкий. Наши семьи очень обеспокоены, мы испытываем огромное давление", - добавляет он.
Мохаммад - не настоящее его имя. Оно изменено, потому что в Иране критика в адрес правительства может привести к аресту. Тем не менее, несколько врачей из северных провинций согласились рассказать Би-би-си о тяжелых условиях, в которых им приходится работать - и о том, как, по их мнению, правительство плохо справляется с кризисом.
"У нас даже нет достаточного количества масок. Медицинские работники умирают ежедневно", - рассказывает Мохаммад."Я не знаю, сколько человек умерло, но правительство пытается скрыть истинный масштаб кризиса. Они лгали в первые дни вспышки", - говорит он.
Covid-19 распространился по всем 31 провинциям Ирана всего за 16 дней. Кроме того, 16 стран заявляют, что первые случаи заражения вирусом попали к ним из Ирана. Это Ирак, Афганистан, Бахрейн, Кувейт, Оман, Ливан, ОАЭ, Канада, Пакистан, Грузия, Эстония, Новая Зеландия, Беларусь, Азербайджан, Катар и Армения. Несмотря на это, как считают критики властей, правительство Ирана продолжается занижать масштаб вспышки коронавируса.
В первом официальном заявлении о вирусе 19 февраля правительство советовало не беспокоиться, а верховный лидер Ирана аятолла Али Хаменеи обвинил "врагов" Ирана в том, что те преувеличивают масштаб угрозы. Неделю спустя, когда число заразившихся и умерших быстро росло, президент Хасан Рухани заявил о "вражеском заговоре", имеющем целью запугать иранцев и остановить жизнь в стране. Президент призывал иранцев продолжать свою повседневную жизнь и ходить на работу. Контролируемые государством каналы недавно объявили, что коронавирус может быть произведенным в США "биологическим оружием", а Хаменеи написал в "Твиттере" о "биологической атаке".
К субботе число умерших от Covid-19 в Иране перевалило за полторы тысячи человек, инфицированных - больше 20 тысяч. Врачи из трех наиболее пострадавших провинций Ирана - Гилан, Голестан и Мазандарн - рассказали Би-би-си, что тестов на коронавирус в их распоряжении нет, запасы медикаментов ограничены (в том числе базовых), ощущается также нехватка кислородных баллонов, масок, защитных перчаток, халатов. Врачам приходится оборудовать временные полевые госпитали. Одна из реаниматологов рассказала, что у них в городе койки для прибывающих пациентов расставили на футбольном стадионе.
Все без исключения собеседники Би-би-си из числа врачей на основании своего опыта делают вывод о существенном занижении официальной статистики.
Врач из больницы в провинции Голестан подсчитала, что в среднем к ним привозят около 300 новых пациентов ежедневно. По ее оценкам, 60-70% из них заражены коронавирусом, но из-за нехватки мест в стационар кладут только тех, кто в критическом состоянии. А официальная статистика учитывает только тех, кто оформлен и лежит в больнице. На протяжении последних двух недель, по словам этого врача, у нее умирали примерно по пять пациентов в день. Зачастую больные умирали, не дождавшись проведения анализа на Covid-19.
Умирают и сами врачи. 25-летняя медсестра из города Лахиджан умерла в конце февраля. Фото умершей стала вирусным в социальных сетях. Правительство отрицало, что она скончалась от Covid-19.
Контролируемые государством телеканалы продолжали изображать медиков как неуязвимых и полных сил героев, которые бесстрашно сражаются с вирусом и спасают жизни. Вскоре после ее смерти Иранская организация медсестер подтвердила, что она умерла от коронавируса.
По данным властей, "нулевых пациентов" - тех, с кого началась вспышка - было двое, оба умерли 19 февраля в Куме. Один из них, как сообщалось, был бизнесменом и заразился короновирусом в Китае.
Город Кум быстро стал очагом заражения. Кум - центр паломничества мусульман-шиитов. Здесь ведущие исламские священнослужители страны, сюда ежегодно прибывают около 20 миллионов иранцев и еще и 2,5 миллиона иностранцев. Каждую неделю тысячи паломников прибывают в город, они целуют и прикасаются к многочисленным святыням.Вирус быстро распространялся, число случаев заболевания начало расти. Но вместо того, чтобы быстро изолировать город, соратники верховного аятоллы - например, священнослужитель Мохаммад Саеди - выступали за то, чтобы паломники продолжали посещать город. "Мы считаем этот святой город местом исцеления. Это значит, что люди должны прибывать сюда, чтобы исцелить как духовные, так и физические болезни", - говорил он.
Региональный директор Всемирной организации здравоохранения по чрезвычайным ситуациям Ричард Бреннан, недавно вернувшийся из Кума, сказал: "Из-за особой религиозной специфики Кума, когда паломники прибывают и из Ирана, и из-за рубежа, вирус быстро распространился по всей стране". Бреннан также заявлял, что во время своего визита видел "подлинные усилия", направленные на то, чтобы обеспечить работу медиков в лабораториях и больницах в Куме и Тегеране. Священные места в Куме сейчас уже закрыты.
В феврале состоялись два важных для страны события - 41-я годовщина Исламской революции и выборы в парламент. "Первые дни, когда я и мои коллеги зарегистрировали аномальное респираторное заболевание, были за несколько дней до дня победы Исламской революции 11 февраля", - вспоминает высокопоставленный врач. По его словам, он отправлял многочисленные отчеты из своей больницы чиновникам министерства здравоохранения в Тегеране, предупреждая о вспышке.
"Мы считаем, что представители системы здравоохранения решили скрыть тот факт, что коронавирус пришел в Иран. Чтобы не срывать государственные мероприятия", - говорит он.
И годовщина революции, и выборы рассматривались как проверка популярности правительства после шести месяцев хаоса, пережитого иранцами. Речь идет о масштабных протестах в ноябре, которые начались после повышения цен на топливо, а также об обострении отношений с США. Оно произошло после того, как Иран атаковал базу в Ираке, где размещались американские военные, после гибели главы спецподразделения Корпуса стражей исламской революции Ирана Касема Сулеймани. Крушение украинского самолета, которое привело к гибели 176 человек, также подорвало общественное доверие к власти, ведь официальные лица поначалу отрицали, что лайнер был сбит ракетой. После выборов Хаменеи обвинил "врагов" Ирана в том, что они преувеличивали угрозу коронавируса, чтобы удержать избирателей подальше от избирательных участков.
Недавно министр здравоохранения Ирана Саид Намаки отверг упреки в задержке сообщений о коронавирусе. Государственное телевидение сообщило: "О первых случаях заражения было объявлено сразу же [19 февраля], хотя выборы должны были состояться в пятницу [21 февраля]". Спустя пять дней после выборов число официально подтвержденных случаев выросло до 139, летальных исходов - до 19. В тот же день депутат от Кума Ахмад Амирабади Фарахани на заседании парламента объявил, что в его городе за две недели умерли 50 человек.
Замминистра здравоохранения Ирана Ирадж Хариричи отрицал сказанное депутатом и обещал подать в отставку, если количество умерших достигнет хотя бы половины этого числа. В тот же день Хариричи начал потеть и кашлять во время пресс-конференции. Позже он объявил, что тест на коронавирус дал положительный результат, став первым из многих высокопоставленных иранских политиков, которые заразились.Как сообщается, Хариричи выздоровел, он появился в прямом телеэфире 13 марта.
Многие эксперты и журналисты полагают, что официальные данные о вспышке коронавируса в Иране - значительная и опасная недооценка истинных масштабов кризиса. Расследование, проведенное Персидской службой Би-би-си, показало, что в Иране от коронавируса умерли в шесть раз больше человек, чем на тот момент сообщало министерство здравоохранения страны. Но поскольку даже официальные данные продолжают расти, вопрос для иранцев сейчас заключается в том, как остановить вирус.
Отец Алирезы скончался в середине марта. "Ни один человек из нашей семьи не был на похоронах. Я даже не увидела его тела. Они просто сказали нам, что он умер и уже похоронен в особой зоне главного тегеранского кладбища", - вспоминает она. В целях безопасности имя Алирезы было изменено. Власти сказали семье, что не надо собираться на похороны и что можно будет посетить могилу после погребения. А на кладбище сотрудники ей сказали, что находиться там небезопасно, поскольку хоронят много других тел. "Об этих похоронах мы говорим больше, чем о смерти отца", - говорит Алиреза. "Я не религиозна, - добавляет он. - Но у меня осталось странное чувство, как будто мы не проявили уважения к отцу". Все похороны с участием большого числа людей в Иране сейчас запрещены. Несколько аятолл, включая верховного, издали фетвы против традиционного обмывание покойных. Цель - оградить от коронавируса тех, кто обмывает тела перед похоронами.
ВОЗ призывает к срочным и решительным действиям, но реакция Ирана по-прежнему не соответствует мерам, осуществляемым в таких странах, как Китай или Италия. Школы, университеты и семинарии закрыты, футбольные матчи отменены, а в Тегеране началась широкомасштабная операция по дезинфекции. Всем жителям Ирана предписано оставаться дома. Впервые с момента создания Исламской республики в 1979 году отменены пятничные молитвы. Пытаясь предотвратить распространение болезни в переполненных тюрьмах, 155 тысяч заключенных были временно освобождены. В том числе политзаключенные - например, Назанин Загари-Рэтклифф, британка иранского происхождения, сотрудница благотворительной организации.
Большинство правительственных зданий, офисов и банков остаются открытыми.
Даже для иранцев, относящихся к среднему классу, например, для учителя-пенсионера Фатемы и ее мужа (имена изменены), проблемой остается привязка к наличным деньгам, без которых нельзя приобрести ни продукты, ни топливо. "Мы вынуждены ходить в банк, чтобы получать ежемесячную пенсию. И к Новрузу тоже ожидается выплата - надо будет получить ее на руки", - говорит она. Специалисты-медики и в Иране, и за его пределами говорят, что если правительство не сделает информацию прозрачной и не предпримет меры для карантина целых городов, таких как Кум, вирус продолжит наносить вред всей стране.
Президент Рухани неоднократно заявлял, что правительство не будет закрывать города, что все магазины будут работать, а жизнь будет идти своим чередом. Персидский Новый год - главный праздник для иранцев. Аятолла Хаменеи в своей речи говорил о невероятных жертвах, которые принес народ, борясь со вспышкой коронавируса. Для Фатемы еще никогда не было менее подходящего момента для праздника.
"За всю свою жизнь я даже не помню такого Новруза, чтобы оставаться дома в одиночестве. Даже во время войны, когда Саддам [Хусейн] начал обстреливать города ракетами, мы навещали друг друга во время Новруза", - вспоминает она.
Конкурирующие интересы: авторы заявили, что конкурирующих интересов не существует.
Интерпретировал данные: М. Мохраз. Разработанное исследование: EM HJ AM. Собранные образцы и интерпретировали данные: EM HK HJ KK AM. Задуманные и разработанные эксперименты: FJ KA WS JH SRM AM MRA. Выполнял эксперименты: Ф. Дж. М. Мацуда. Используемые реагенты / материалы / инструменты анализа: М. Мохраз С.И. Написал газету: FJ JH.
Лекарственный (DR) ВИЧ возникает во время комбинированного антиретровирусного лечения (CART), что вызывает озабоченность по поводу широко распространенной передачи DR-HIV, поскольку в странах с ограниченными ресурсами расширяется КОРТ. Цель этого исследования состояла в том, чтобы определить преобладающие подтипы ВИЧ-1 и распространенность переданных DR мутаций среди пациентов с антиретровирусным наивностью в Иране.
Для мониторинга передачи ВИЧ-инфекции в Иране был внедрен пороговый надзор, основанный на руководящих принципах Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ).
Для этого исследования по наблюдению за порогом ВИЧ-инфекции образцы крови были собраны у 50 ВИЧ-1-инфицированных пациентов с антиретровирусными препаратами. Антиретровирусные резистентные мутации определяли путем секвенирования протеазы ВИЧ-1, области обратной транскриптазы и интегразы. Подтип ВИЧ-1 определяли путем секвенирования областей p17 и C2-V5 гена gag и env соответственно.
Филогенетический анализ секвенированных областей показал, что 45 (95,7%) из 47 образцов, которые были успешно получены, были CRF35_AD. Остальные два случая были подтипом B (2,1%) и CRF01_AE (2,1%). Последовательные результаты были получены также из последовательностей Env и Gag. Что касается распространенности передаваемых DR-вирусов, было обнаружено, что два случая содержат мутации, устойчивые к обратной транскриптазе-ингибиторам (4,3%). Кроме того, хотя в списке ВОЗ для наблюдения за передаваемыми мутациями не было обнаружено 13 незначительных мутаций, резистентных к ингибиторам протеаз, перечисленных в Международной группе СПИД-СПИД-США, были обнаружены мутации. В области интегразы мутаций DR не обнаружено.
В нашем исследовании выяснилось, что CRF35_AD является основным подтипом среди ВИЧ-1-инфицированных пациентов в Иране. Согласно методу категоризации ВОЗ в отношении порогового обследования по ВИЧ-инфекции, распространенность ВИЧ-инфекции, передающейся через лекарственные средства, в Иране оценивалась как умеренная (5-15%).
Выбор и приобретение лекарственной устойчивости ВИЧ-1 неизбежно связаны с комбинированным антиретровирусным лечением (КОРМ) ВИЧ-1-инфицированных пациентов. Таким образом, появление лекарственно-устойчивого (DR) ВИЧ является серьезной проблемой в качестве потенциального следствия расширения КАРТ [1]. Действительно, расширение КОРТ может быть поставлено под угрозу благодаря широко распространенной передаче DR-HIV [2], особенно в странах, где антиретровирусные варианты ограничены.
Первым ВИЧ-инфицированным случаем в Иране был гемофильный пациент, идентифицированный в 1986 году, и первые случаи передачи ВИЧ через инъекции наркотиков были зарегистрированы в 1989 году [3]. По состоянию на март 2012 года в Иране зарегистрировано 24290 ВИЧ-1-инфицированных людей [4]. Пути передачи были приписаны инъекционным наркотикам (69,6%), сексуальному контакту (10,5%), переливанию продуктов крови (1,0%) и передаче от матери ребенку (0,1%) [4]. Иран испытывает концентрированную эпидемию ВИЧ-1 среди потребителей инъекционных наркотиков (ПИН) [5], [6].
В Иране в 1997 году была внедрена КОРМ, когда антиретровирусные препараты зидовудин, ламивудин и индинавир стали доступными как часть системы здравоохранения страны, что позволило увеличить количество лекарств в Тегеране и других городах, таких как Керманшах и Шираз [7]. Впоследствии индинавир был заменен нелфинавиром из списка иранских непатентованных лекарств. Позже, ставудин, невирапин и диданозин в 2005 году, эфавиренц, лопинавир / ритонавир, тенофовир и абакавир в 2006 году, атазанавир в 2011 году стали доступны для пациентов с ВИЧ / СПИДом [3], [7]. В соответствии с руководящими принципами Ирана по клинической помощи пациентам с ВИЧ / СПИДом, в которых указаны 14 возможных комбинаций из трех препаратов из антиретровирусных препаратов, упомянутых выше [3]. КАРТ бесплатно предоставляется пациентам с ВИЧ / СПИДом в консультационных и поведенческих центрах (треугольные клиники) [7].
В дополнение к получению КОРТ, все пациенты с ВИЧ / СПИДом в Иране периодически контролируются правительством США для подсчета количества лимфоцитов CD4 +. С другой стороны, иранские руководящие принципы не включают измерение вирусной нагрузки. Аналогичным образом, мониторинг лекарственной устойчивости доступен на ограниченной основе, и он не проверяется у каждого иранского пациента на лекарственную устойчивость. Поэтому для решения проблем, связанных с появлением и передачей DR-HIV в Иране, мы провели выборочный опрос среди лиц, не получающих наркотики, в соответствии с рекомендациями Всемирной сети здравоохранения (ВОЗ). В этом исследовании мы сообщаем о предполагаемой распространенности передачи DR-HIV в Иране.
Образцы были собраны в соответствии с рекомендованным ВОЗ ВОЗ для оценки DR-HIV в странах с ограниченными ресурсами [6]. Лица были набраны из всех центров консультирования и поведенческих исследований в Тегеране с января 2010 года по февраль 2011 года, если они соответствовали этим критериям приемлемости: в возрасте до 25 лет при диагнозе ВИЧ и отсутствии беременности для женщин [8]. Однако после этих 9 месяцев были набраны только 15 вновь выявленных случаев. Таким образом, после консультаций с экспертами ВОЗ, чтобы сократить период сбора проб, критерии включения были расширены до менее 30 лет, количество лимфоцитов CD4 +> 500 / мкл, без предшествующих беременностей для женщин и без предварительного воздействия антиретровирусных препаратов. В дополнение к Тегерану, образцы были собраны из двух других районов Ирана, Керманшаха на западе и Шираза на юге Ирана, где антиретровирусная терапия была начата одновременно с Тегераном.
В этом исследовании были введены новые диагностированные, антиретровирусные наивные ВИЧ-1 пациенты (n = 50). Они посетили центры консультирования и поведенческих исследований в Тегеране (n = 30), Керманшах (n = 10) или Шираз (n = 10) в период с января 2010 года по февраль 2011 года. После того, как пациенты подписали информированное согласие, 10 мл их периферической крови были собраны в ЭДТА-содержащие вакуутерные трубки. Образцы плазмы получали центрифугированием, а аликвоты хранили при -70 ° С до использования. Если возможно, каждому пациенту было предложено заполнить анкету о базовой информации пациента, включая возраст, пол, рискованное поведение, семейное положение и статус вируса гепатита В (HBV) или вируса гепатита C (HCV).
Это исследование было одобрено комитетами по этике исследований медицинских наук в Тегеранском университете медицинских наук и Министерством здравоохранения и медицинского образования.
Мы использовали протокол генотипического тестирования лекарственной устойчивости, описанный ранее Sugiura, et al. с некоторой модификацией [9]. Вкратце, вирусная РНК была экстрагирована из 140 мкл плазмы QIAamp Viral RNA Mini Kit (Qiagen, Tokyo, Japan) в соответствии с инструкциями производителя. Нуклеотидные последовательности цельной протеазы ВИЧ-1 (PR, HXB2, положение 2253-2549), N-концевая часть обратной транскриптазы (RT, 2550-3269) и полноразмерной интегразы (INT, 4230-5093) амплифицировали с использованием области -специфические праймерные пары путем обратной транскрипционной (RT) -полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием одностадийной RT-PCR системы SuperScript III с платиновым комплектом высокой точности Taq (Life Technologies Corp., Токио, Япония) и еще более усиливаются в гнездо ПЦР с использованием LA Taq (Takara Bio Inc., Shiga, Japan). После гель-электрофореза амплифицированные продукты ПЦР очищали с помощью набора QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen, Tokyo, Japan). Реакцию секвенирования проводили с использованием набора для определения последовательности терминатора BigDye v3.1 (Applied Biosystems, Tokyo, Japan). Нуклеотидные последовательности были определены на генетическом анализаторе ABI PRISM 3130 (Applied Biosystems). Последовательные данные были сопоставлены с HXB2, а мутации аминокислот были обнаружены программным обеспечением SeqScape 2.5 (Applied Biosystems). Присутствие переданных ВИЧ-1 мутаций, резистентных к лекарственным средствам, определялось с использованием списка мутаций ВОЗ [10].
Для определения подтипа каждого образца нуклеотидные последовательности, включающие p17 гена gag (положение Gag, HXB2 708-1230) и область C2-V5 гена env (Env, 6934-7651), определяли с использованием того же протокола, что и для лекарственно-устойчивого генотипического теста, описанного выше. Нуклеотидные последовательности, полученные для Gag и Env, а также PR, RT и INT были выровнены ClustalW, а филогенетические деревья были сконструированы с использованием метода соседнего соединения с 1000 бутстрапами, реализованных в MEGA 5 [11].
Нуклеотидные последовательности, полученные в этом исследовании, были депонированы в ДНК-банке данных Японии и доступны под следующими регистрационными номерами: AB716095-AB716141 для PR и RT, AB716142-AB716188 для INT, AB716189-AB716232 для Gag и AB716233-AB716276 для Env. Следует отметить, что одна из env-последовательностей содержала неоднозначные области. Таким образом, он был представлен в двух частях: AB716271 и AB716272.
Исходная информация о 50 новых диагностированных случаях инфицирования ВИЧ-1 приведена в таблице 1. Более половины исследуемых случаев составили мужчины (64,0%) и в возрасте 25-30 лет (56,9%). Их средний возраст составлял 26,0 года. Среди 35 участников, заполнивших анкету, 51,4% были инфицированы инъекциями наркотиков. Вместе с 9 людьми, которые заразились ВИЧ через гетеросексуальные контакты с партнерами ПИН, доля передачи, связанная с ПИН, составляет 77,1%. Совместная инфекция вирусом гепатита С и вирусом гепатита В была идентифицирована среди 46,7% и 7,1% из 30 и 28 испытуемых участников, соответственно.
Информация по полу, возрасту и городу проживания была получена из всех 50 дел, которые заполнили вопросник.
Информация о семейном положении и маршруте передачи была получена из 35 дел, которые заполняли вопросники.
Инфекция вирусом гепатита С и вирусом гепатита В была протестирована в 30 и 28 случаях соответственно.
Из 50 собранных образцов 47 были успешно секвенированы в регионах PR, RT и INT (94,0%). Филогенетический анализ этих последовательностей PR, RT и INT показал, что 45 из 47 образцов были CRF35_AD (95,7%), один был подтипом B (2,1%), а один был CRF01_AE (2,1%) (фиг.1A-C). Амплификационные и нуклеотидные последовательности Gag и Env были успешно получены из 44 (88,0%) и 43 (86,0%) образцов соответственно. Последовательные результаты были получены из филогенетических анализов последовательностей Gag и Env, и не было обнаружено несоответствующего случая (рис. 1D, E).
(A), (B) обратную транскриптазу, (C) интегразу, (D) gag и (E) env. Деревья были построены с использованием метода соседнего соединения с 1000 повторов. Две последовательности, каждая из 6 подтипов ВИЧ-1, полученных из GenBank, включены в качестве ссылок. Открытые круги (○) указывают ссылочную последовательность CRF35_AD, открытые квадраты (□) указывают подтип A1, открытые треугольники (▵) указывают A2, открытые алмазы (◊) указывают подтип D, замкнутые круги (•) указывают подтип B и закрытые квадраты (▪) указывают CRF01_AE. Показаны значения ботстрапа более 70%.
Наблюдаемые лекарственно-устойчивые мутации (SDRM), связанные с передачей резистентности к ВИЧ-1 [10], были обнаружены в гене RT двух образцов. Оба SDRM были связаны с мутациями резистентности к ингибиторам обратной транскриптазы (NRTI) нуклеотидов: T215D, обнаруженным у пациента из Керманшаха и K219Q у пациента из Тегерана (таблица 2).
IAS-USA, международное антивирусное общество — США; NRTI, ингибитор обратной транскриптазы нуклеозидов; PI, ингибитор протеазы; SDRM, эпиднадзор лекарственно-устойчивых мутаций.
Кроме SDRM в списке ВОЗ [10] было обнаружено 13 незначительных мутаций в PR-ген, перечисленных в панели IAS-USA [12] (таблица 2). M36I был обнаружен во всех случаях (100%), H69K и L89M были обнаружены во всех случаях, кроме одного образца подтипа B (97,9%), а K20R был обнаружен в 46 образцах (97,9%), и они считаются полиморфными не-B ВИЧ. Кроме того, были обнаружены L10V, V11I, G16E, L33V, D60E, I62V, L63P, I64L и I93L, но были менее распространены. Внутри гена INT мы не обнаружили мутаций, связанных с лекарственной устойчивостью, перечисленных в группе IAS-USA [12].
Здесь мы сообщаем о распространенном типе ВИЧ-1 и распространенности DR-HIV среди 50 вновь выявленных случаев ВИЧ-1-инфицированных в трех разных городах Ирана. Из 47 последовательных образцов 45 образцов (95,7%) были определены как CRF35_AD, один образец (2,1%) в качестве подтипа B и другой (2,1%) в виде CRF01_AE. Наши результаты согласуются с двумя недавними сообщениями о преобладании CRF35_AD в Иране [13], [14]. До 2007 года подтип A1 был зарегистрирован как преобладающий подтип ВИЧ-1 в Иране [15] — [17]. Однако, когда мы получили эти последовательности Env и Gag ВИЧ-1, зарегистрированные как подтип A1 до 2007 года, и провели филогенетический анализ, мы обнаружили, что они делают очевидный кластер с CRF35_AD (данные не показаны). Этот результат свидетельствует о том, что CRF35_AD циркулирует в Иране еще до 2007 года. В совокупности эти результаты показывают, что преобладающим ВИЧ-1 в Иране является CRF35_AD.
Читайте также: