Анализ нуклеиновой кислоты коронавируса

Последнее время, меня стали напрягать новости из Китая, а именно новости о новом коронавирусе 2019-nCoV.

В своем блоге буду писать информацию по данному вирусу, а также публиковать последние новости в разделе новостей.

Я не имею специального медицинского образования, поэтому буду писать так как сам понимаю, а также попытаюсь собрать информацию по коронавирусу в одном месте.

Ну давайте начнем.

Коронавирусы — семейство вирусов

Коронавирусы – семейство вирусов, которые вызывают ряд заболеваний у людей, это может быть обычная простуда, ринит, в более тяжелых случаях
атипичная пневмония и тяжелый острый респираторный синдром.
Атипичная пневмония — это воспаление легких, вызванное нетипичными вирусами, протекает атипичная пневмония без симптомов, свойственных обычной пневмонии.
Также коронавирусы могут вызывать воспалительные процессы пищеварительного тракта и в редких случаях оказывает влияние на нервную систему.
Назвали вирус так из-за внешнего вида, эти микробы сферической формы, они имеют оболочку с редкими шипами, ворсинками.
Коронавирус содержит одноцепочечную молекулу РНК (рибонуклеиновая кислота)
Впервые коронавирус открыли в 1965 году.
На долю коронавирусов приходится от 4 до 20% всех ОРВИ.

Строение и генетический цикл коронавируса

Как коронавирус проникает в клетку

Вирус попадает внутрь клетки и размножаются в цитоплазме.
Они подавляют иммунокомпетентные клетки, иммунитет организма снижается, организм перестает бороться с вирусом.
Иммунокомпетентные клетки он использует как транспорт, поэтому вирус и захватывает быстро весь организм.
Коронавирус погибает при температуре от 56 градусов.
Штамы 229Е, NL63, OC43 и HKU1, вызывают ОРВИ и болезни верхних дыхательных путей.
Большинство людей заражаются и излечиваются от эти штамов вирусов в течении жизни.
Такие заболевания проходят за короткий промежуток времени.

Симптомы:

• насморк
• головная боль
• кашель
• боли в горле
• лихорадка
• общее чувство недомогания

Чаще такие заболевания встречается у людей, страдающих сердечно-легочными заболеваниями, или ослабленной иммунной системой, детей и стариков.

MERS-CoV, SARS-CoV, 2019-nCoV, это вирусы которые вызывают более тяжелые последствия.

Информация о 2019-nCoV

Штамм 2019-nCoV впервые обнаружили в Китае.

Город обнаружения: город Ухане
Ухань — город субпровинциального значения в провинции Хубэй КНР, административный центр этой провинции.
Самый густонаселенный город центрального Китая с населением 12 млн чел. Стоит на месте слияния рек Янцзы и Ханьшуй.
На местном рынке, на котором продавались мясо, рыба и животные живком.

Хронология и краткая информация о вирусе.

Способ обнаружения: анализ нуклеиновой кислоты

Распространение вируса и его носители

12 января 2020 года в Шанхай приехала жительница Уханя, заболевшая дома 10 января.

15 января она обратилась в амбулаторию, была изолирована, через 6 дней выздоровела и была выписана.

Это первый лабораторно-подтверждённый случай инфекции 2019-nCov в Шанхае.

Коронавирусная инфекция является зооантропонозной, то есть возможна передача от животных к человеку.

Выяснено, что источником SARS-CoV были циветы, а MERS-CoV — одногорбые верблюды.

Возможно, что и в случае 2019-nCoV источником инфекции являются животные — генетический анализ вируса выявил схожесть с коронавирусами,
распространёнными среди подковоносых летучих мышей, однако пока достоверно не известно, являются ли они изначальным источником инфекции.

Как передается вирус. Способы передачи вируса

Вирус передается воздушно-капельным путем от человека к человеку, вначале ученые думали, что вирус передается через рыбные продукты, но эта версия не подтвердилась.

Всемирная организация здравоохранения подтвердила, что есть случаи заражения до четвертого поколения (1чел-2чел-3чел-4чел)

Симптомы вируса заражения вирусом 2019-nCoV

Симптомы коронавируса похожи на симптомы пневмонии или тяжёлого острого респираторного синдрома

• потеря сознания(от разрушения лёгочных тканей)
• сухой, непродуктивный кашель
• лихорадка
• повышение температуры 38 С и выше
• озноб
• затруднённое дыхание
• боли в области груди
• головная боль
• миалгия
• общее недомогание

Инкубационный период

Инкубационный период длится в течение 5—12 дней.
Разница в сроке периода зависит от способа заражения
Если инфицирование произошло от человека к человеку, то инкубационный период не превышает пяти дней.
При передаче вируса от животных сроки инкубационного периода увеличиваются до 12 дней.
По предварительным данным вирус особо заразен и передается при контакте от человека к человеку.

Лица, контактировавшие в домашних или больничных условиях с заболевшими, наиболее подвержены возникновению
стадии острого респираторного заболевания, в случае которого непосредственной причиной смерти является
прогрессирующая острая неконтролируемая дыхательная недостаточность (респираторный дистресс-синдром).

Лечение вируса 2019-nCoV

Специфическая противовирусная терапия для него ещё не разработана.

Лечение: патогенетическое, симптоматическое.

Профилактика вируса 2019-nCoV

• при планировании зарубежных поездок уточнять эпидемиологическую ситуацию;
• не посещать рынки, где продаются животные, морепродукты;
• употреблять только термически обработанную пищу, бутилированную воду;
• не посещать зоопарки, культурно-массовые мероприятия с привлечением животных;
• использовать средства защиты органов дыхания (маски);
• мыть руки после посещения мест массового скопления людей и перед приемом пищи;
• при первых признаках заболевания, обращаться за медицинской помощью в лечебные организации, не допускать самолечения;
• при обращении за медицинской помощью на территории Российской Федерации информировать медицинский персонал о времени и месте пребывания в КНР.

Принимаемые меры в Российской Федерации:

• В пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации проводится усиленный контроль прибывающих из эпидемически неблагополучных регионов лиц.
• Проведение лабораторных исследований клинического материала от лиц с симптомами острых респираторных инфекций (ОРВИ), прибывших из КНР в течение 14-ти дней, на 2019-nCoV.

Может ли коронавирус распространяться по почте или с товарами Aliexpress из Китая?

Это крайне маловероятно. Хотя еще предстоит узнать о том, как этот конкретный вирус распространяется, на это уйдет время,
коронавирусы, как правило, не живут очень долго на поверхностях, и очень маловероятно, чтобы они смогут выжить в течении нескольких дней
или недель доставки посылки. Также все посылки проходят обработку.

Распространение вируса на 28.01.2020

Места, где подтвердились случаи заражения вирусом 2019-nCoV

• Китай
• Гонконг
• Макао
• Тайвань
• Австралия
• Камбоджа
• Канада
• Франция
• Япония
• Малайзия
• Непал
• Сингапур
• Таиланд
• Республика Корея
• Соединенные Штаты
• Вьетнам

Хождение по врачам

По данным счетчика издания China Daily Morning Post, на вечер 26 февраля число зарегистрированных случаев COVID-19 в мире достигло 81 100, от болезни умерли 2 769 человек. Более 3 тыс. заболели за пределами материковой части Китая. На втором месте после КНР по числу заболевших находится Южная Корея, где зарегистрирован 1 261 случай заболевания и 12 смертей. Далее в рейтинге следует судно Diamond Princess, вставшее на рейд у берегов Японии, на котором зафиксирован 691 случай заболевания и четыре летальных исхода. На четвертом месте антирейтинга — Италия, где заболели 323 человека, 11 скончались.

Россия пока остается в числе стран, которые новый коронавирус почти не затронул. По сообщениям Роспотребнадзора, выявлены только два случая заболевания (у граждан КНР), и оба инфицированных уже выздоровели. Также врачи признали коронавирус у троих россиян, находящихся на карантине в Казани. Больные были доставлены в Россию 22 января во время эвакуации пассажиров круизного лайнера Diamond Princess. COVID-19 был обнаружен у них во время нахождения на борту корабля.

Звонок в консультативно-профилактическое отделение больницы также не добавил ясности.

— Врачи поликлиники обязаны были связаться с нами, предложить госпитализацию и дать направление, — сообщила сотрудница отделения. — Они не должны были отправлять вас решать вопрос самостоятельно.

— Обращайтесь в районную поликлинику. Там должны забрать кровь и доставить к нам на исследование. У нас сейчас это поставлено на поток. Но в Центре гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора нет лицензии на забор материала, поэтому забор и доставку осуществляют медицинские организации. Однако для анализа нужны показания. Если у вас есть повышенная температура, сообщите, что плохо себя чувствуете. А если в поликлинике отказываются взять анализ, требуйте и жалуйтесь, — посоветовала оператор горячей линии.

Таким образом, круг замкнулся.

Весомые аргументы

— Также мы должны в обязательном порядке выяснять у всех больных историю их перемещений. Если пациент прибыл из региона, где зафиксированы вспышки коронавируса, и демонстрирует симптомы инфекции, то его необходимо госпитализировать. Сейчас есть установка на то, чтобы направлять в карантин всех иностранцев с температурой, прибывающих в аэропорты. Решение о госпитализации медики принимают в каждом конкретном случае, — рассказал врач скорой помощи.

Глава надзорного ведомства Анна Попова в среду после заседания оперативного штаба по предупреждению завоза и распространения нового коронавируса на территории России заявила, что сегодня случаи инфекции регистрируют у себя 39 стран и поэтому возможность завоза COVID-19 в нашу страну, безусловно, возрастает.

А вице-премьер Татьяна Голикова уточнила, что на заседании штаба договорились дополнительно дать поручение Минздраву совместно с Роспотребнадзором еще раз взглянуть на систему реагирования на жалобы пациентов: чего не хватает, требуются ли дополнительные финансовые вложения или методологическая помощь, чтобы правильно организовать эту работу.

Кошмар ипохондриков

Как рассказал источник, знакомый с организацией производства теста на коронавирус, проблемы с забором анализов могут быть связаны с организационными моментами. По его словам, видов теста только два и их зарегистрировали буквально на днях, поэтому в Москве их может еще не быть. При этом они не дороже, чем аналогичные ПЦР-тесты на гепатит, ВИЧ и грипп — их стоимость от 500 до 1 тыс. рублей.

— Я думаю, что в будущем тест на наличие в организме коронавируса станет доступнее и тогда появится возможность провериться платно, но пока, по моему мнению, всё весьма рационально и правильно организовано, — заключил Сергей Нетёсов.

Где этот тест

При этом назвать существующие тест-системы стопроцентной диагностикой нельзя, считает Иван Коновалов.

МОСКВА, 24 января. /ТАСС/. Диагностику нового типа коронавируса в РФ в связи с отсутствием специальных тестов сегодня проводят традиционным методом полимеразной цепной реакции (ПЦР), сообщила журналистам в пятницу заместитель директора по научной работе Научно-исследовательского института гриппа Минздрава РФ (Санкт-Петербург), кандидат биологических наук Дарья Даниленко. По словам опрошенных ТАСС ученых, такая диагностика может занимать от нескольких часов до 2 дней.

Полимеразная цепная реакция - экспериментальный метод, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определенных фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) в биологическом материале.

"Есть более традиционные, пускай и долгие, методы диагностики, которые очень точно позволяют установить наличие коронавируса. Это метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) с последующим секвенированием. Это сложный метод, такие исследования проводят специализированные лаборатории, и не все больницы способны проводить такие исследования", - отметила Даниленко.

Сколько длится исследование

Как пояснила ТАСС главный инфекционист Новосибирской области Лариса Позднякова (в Новосибирске расположены уникальные учреждения, ориентированные на разработку и внедрение вакцин и лекарств, в частности Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"), максимальное время диагностики таким методом - до двух суток.

"Время диагностики вируса методом ПЦР зависит от тест-системы, которая используется. Иногда анализ может занимать четыре-восемь часов, максимальное время диагностики - двое суток, но обычно результат готов в течение одних суток", - отметила Позднякова.

Тест-систем, которые позволяют быстро выявлять новый тип коронавируса, в течение нескольких минут, на данный момент нет. Однако эксперты отмечают, что в современных условиях разработать их несложно.

"На самом деле, проблем диагностики нет, системы есть, но, может, они существуют не в таком массовом масштабе, потому что ранее коронавирусная инфекция все-таки больше циркулировала среди животных, и вот только относительно недавно стало известно, что она передается человеку, поэтому ту систему, которая определяет коронавирус, нет проблем сделать. Они есть, их просто нужно массово масштабировать", - уверена Позднякова.

Особенности лечения

На данный момент не существует и специальных противовирусных препаратов, направленных непосредственно на возбудителей нового типа коронавируса. В то же время, по словам Даниленко, лечить зараженных новым типом коронавируса можно.

"Лечение понятно, потому что есть протокол ВОЗ, пациент будет изолирован и дальше в зависимости от тяжести и течения инфекции у него будет противовирусное профилактическое лечение. Но специализированных противовирусных препаратов против коронавируса пока нет", - отметила эксперт, добавив, что большинство пациентов, у которых инфекция была лабораторно подтверждена, выздоравливает. Летальные исходы, как правило, связаны с сопутствующими болезнями зараженных.

"У ряда людей с ослабленным иммунитетом может наблюдаться тяжелое течение болезни. Большинство летальных исходов связаны с тем, что у пациентов были какие-то сопутствующие заболевания, достаточно тяжелые, до того, как они заболели новым возбудителем", - отметила Даниленко.

Опасность коронавирусной инфекции в том, что осложнением является вирусная пневмония, она отличается от бактериальной, поясняет Позднякова. "У нее очень быстрое развитие, она имеет специфическую картину", - отмечает эксперт.

Вакцина от коронавируса

Чтобы разработать вакцину от нового типа коронавируса, может понадобиться несколько лет. "Должно быть проведено серьезно исследование коронавирусов. Такие исследования занимают несколько лет. Это три-пять лет. Но даже разработав такой потенциально профилактический или потенциально терапевтический препарат, потребуются годы на проведение клинических исследований", - считает заведующая лабораторией молекулярной микробиологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Нина Тикунова.

Она не сомневается, что российские ученые справятся с этой задачей. В то же время Позднякова отмечает, что вирус может отступить и без вакцины. "Вирус тоже имеет свои циклические законы, поэтому на смену пиковым значениям активности, безусловно, будет и спад инфекции через 3-6 недель, но это закономерный биологический процесс. Естественно, будет снижение, даже без участия вакцинации", - подчеркнула эксперт.

Генетические тесты

Заведующий лабораторией геномной инженерии МФТИ Павел Волчков при этом рассказал, что генетические тесты на базе ПЦР, разработанные в России и Китае, могут находить даже самые незаметные следы нового коронавируса 2019-nCoV всего за три-пять часов, они станут главным инструментом для оценки масштабов распространения инфекции.

"По сравнению со вспышками лихорадки Эбола, в случае с коронавирусом сложность его обнаружения состоит в том, что порождаемые им симптомы схожи с ОРВИ, например, с гриппом. Выявить ложно позитивных-пациентов поможет молекулярно-генетическое тестирование", - сказал Волчков.

Такие системы, как отметил биолог, уже были созданы и развернуты профильными органами Китая, России и других стран. Они основываются на базе так называемой полимеразной цепной реакции (ПЦР).

"Это самый простой и быстрый по ответу тест, который можно создать. Образцом для него может служить сыворотка крови или любые другие физиологические жидкости, например, соскоб со слизистой, слюна. Из них выделяют РНК, производят реакцию обратной транскрипции, чтобы получить ДНК, и используют ее для размножения фрагментов генома вируса с помощью фермента-полимеразы", - пояснил ученый.

Сейчас, как отметил Волчков, медики оценивают масштабы распространения различных опасных инфекций, в том числе птичьего гриппа или лихорадки Эбола, используя инфракрасные камеры и другие системы наблюдений, позволяющие отслеживать внешние симптомы болезни. В случае с коронавирусом 2019-nCoV, для которого характерен длительный инкубационный период и "заурядный" характер течения болезни, схожий с гриппом, сделать это достаточно затруднительно, особенно до того, как его носитель уже успеет вступить в контакт с другими людьми.

"ПЦР-диагностика пока остается самым быстрым способом обнаружения коронавируса. Она позволяет детектировать ничтожные его количества в физиологических жидкостях за очень короткое время. С другой стороны, симптомы могут проявляться не у всех носителей коронавируса из-за инкубационного периода длиной в несколько дней. Поэтому если выяснится, что на борту самолета летел инфицированный пассажир, и его диагноз подтвердится, то в карантин попадут все его попутчики", - подытожил ученый.

— Константин, давайте с вами поговорим про тестирование. В чём проблема тестирования на коронавирус?

— Нет особой проблемы. Есть проблема вообще тестирования. То есть вы хотите определить очень небольшое количество какого-то инородного агента, например по рибонуклеиновой кислоте или по белкам, в случае вируса на фоне очень большого количества молекул, которые находятся в биологической жидкости.

— То есть просто мусора.

— Мусора, да. И сделать вы хотите это точно. У вас может быть ложноположительная реакция — вы говорите, что есть возбудитель, а его на самом деле нет. А есть другая ошибка, реакция ложноотрицательная — вы говорите, что нет возбудителя, а он есть. Цена вопроса, особенно в теперешней ситуации, велика. Поэтому вы хотите сделать тест надёжным. Кроме того, он должен быть сертифицирован, он должен показывать определённую точность, должен быть быстрым, дешёвым, он должен работать как часы, что очень важно. Чтобы сделан не один раз на коленке, а массово произведён. Везде, где можно, должна быть соответствующая аппаратура поставлена, люди должны быть натренированы. Всё это означает, что должна быть система.

— Сейчас в России тестирование на коронавирус проводится одним-единственным способом — полимеразной цепной реакцией.

— С обратной транскрипцией — да.

— Почему?

— Я не знаю, почему. На самом-то деле есть два способа. Вирус — у него есть геном — нуклеиновая кислота, РНК или ДНК, и он запакован в белковую оболочку. И есть два способа тестирования наличия вируса. Вы можете определить наличие нуклеиновой кислоты, это первый вариант. И это делается с помощью такой цепной полимеразной реакции — очень изящной процедуры, которая позволяет при наличии информации о последовательности ДНК или РНК инфекционного агента амплифицировать, размножать специфические последовательности, соответствующие этому агенту, и потом просто детектировать наличие вот такой амплифицированной умноженной последовательности.

— Начали тестировать методом ПЦР — поправьте меня, если я ошибаюсь, — который, как правило, используется для, например, определения вирусной нагрузки. Для того, чтобы определить, сколько вируса.

— Он не количественный. В основном качественный. Есть варианты цепной полимеразной реакции, которая количественная.

— И есть другой принцип — антительный, то есть иммунно-ферментный анализ. Вот почему такой анализ на коронавирус не делается сейчас в России? Это же основной тест в мире.

— И да, и нет. В Китае и других странах тесты на основе цепной полимеразной реакции шире распространены, потому что они очень дешёвые. Их легко сделать, их легко имплементировать.

— ПЦР дешевле, чем ИФА?

— Для цепной полимеразной реакции теста вам ничего не нужно знать, кроме как иметь на компьютере последовательность генома вируса, а дальше вы совершаете некоторые процедуры, которые позволяют вам разработать эту систему. И есть соответствующая база, есть мощные лаборатории по всей стране, включая нашу, которые могут это поставить на поток. У нас клиники типа InVitro занимаются тем, что тестируют людей на различные заболевания с помощью этого теста. У вас вся процедура остаётся точно такой же. Единственное, что меняется, — это реагент, который необходим для определения вот этой конкретной нуклеиновой кислоты. Смотрите, это всё построено на красивом принципе комплементарности. Вы знаете: вот ДНК, двойная спираль. Одна цепочка соответствует другой. И, если вы знаете последовательность нуклеиновой ДНК или РНК в одной цепочке, вы можете разработать другую цепочку, которая будет к ней подходить. И всё, что вам нужно для детектирования коронавируса, — это найти тот участок, который будет подходить.

— То есть там цена исключительно вот в этом реагенте, который на какие-то конкретные нуклеотиды рассчитан?

— Да. Но чтобы это хорошо работало, есть тонкости. С антительными тестами есть проблема. В чём смысл антительного теста: у людей заболевших в кровотоке появляются возбудители, наша иммунная система отвечает на это заболевание производством антител. Антитела — это специальные белки, которые взаимодействуют с инородным агентом и помогают нам его инактивировать. Такое очень специфичное антитело узнаёт только антиген, которому оно соответствует. В нашем случае это будет коронавирус. Соответственно, если у кого-то была коронавирусная инфекция, в кровотоке будут антитела, специфические к этому вирусу.

— Нам нужно много биологического материала.

— И нам нужно детектировать эти антитела. Мы должны уметь их находить. Потому что так можно детектировать тех людей, которые, например, уже вылечились, но инфекция у них была. Они могли не знать, что больны, но у них образовались антитела, которые этот вирус порешили. Обнаруживать таких людей гораздо полезнее с точки зрения эпидемиологии и разработки методов борьбы. ДНК или РНК-вируса у них сейчас уже нет. Остались антитела. Это то, что обеспечивает наш иммунитет. Воспоминания организма и некий его способ бороться с инфекцией, если она вдруг возникнет.

— Удивительно, что основой этого теста являются воспоминания.

— Да. Но для того чтобы такой тест уметь сделать, вам нужно собирать у людей кровь и в этой крови детектировать наличие антитела, специфического к вирусу. Значит, у вас должна быть какая-то подложка, на которую вы кладёте поверхностные белки вируса. Вам нужно такой белок, этот S7, произвести методом генной модификации, выделить его в больших количествах и начать наносить на какие-то бумажки, чтобы потом можно было на эти пробы капать образцы крови различных людей, тестировать. Это в любом случае гораздо сложнее — вам нужно просто произвести большое количество вирусного антигена, знать, какой он, чтобы детектировать антитела.

— Насколько сейчас по всему миру эти тесты различаются? Вот наш анализ, который делается в России, такой же, как анализ, который делается в Италии?

— Есть некоторая опубликованная информация. Например, CDC, американский центр контроля заболеваний, просто предложили, сделали некий стандарт своего теста. Очевидно, что все остальные люди, которые занимаются разработкой этих тестов, используют эту информацию для того, чтобы сделать свои клоны, но, возможно, они это дело улучшают. Касательно наших тестов. На самом деле никто же не делал такой бенчмаркинг.

— Нужно ли тестировать всех? Испанцы взяли и всех протестировали.

— Я совершенно не понимаю, для чего это было нужно, если у людей нет симптомов.

Тот факт, что я вчера был здоров, не означает, что сегодня я не заболел. Поголовное тестирование, кроме того, что будет огромная нагрузка на систему здравоохранения, вряд ли что-то даст.

— Насколько Россия готова к масштабному тестированию?

— По моему опыту, по крайней мере в Москве развёрнута сеть коммерческих клиник, есть Институт эпидемиологии, в котором поставлены на поток такого рода анализы — не в связи с коронавирусом, но их достаточно легко перепрофилировать. Другой вопрос — если тестировать всех, то и эту возможность очень скоро мы насытим. И будут проблемы.

— Как вы думаете, сколько будет сделано тестов?

— Нет проблем перевести это в десятки тысяч, я не вижу проблем на уровне страны. Но я и не вижу необходимости это делать. Тест нужен для подтверждения диагноза, а не просто для того, чтобы приобрести некое спокойствие и дальше потом ходить на работу и нарушать все возможные правила.

— Лежит человек в Коммунарке. Предполагается, что у него может быть коронавирус. И действительно, первый тест показывает коронавирус. Зачем ему делают ещё три теста? Или, например, первый тест не показывает коронавирус. Зачем делают два последующих?

— Если вы рассмотрите геном вируса, там довольно много генов, это всё-таки очень большой вирус, один из самых больших РНК-геномов. И следует смотреть на наличие положительного ответа по нескольким участкам вирусного генома. Потому что, если вы смотрите только на один участок, вы можете ошибиться. И стандартная система действует так: вы смотрите на два места, если оба отрицательных — всё хорошо, если оба положительных — всё плохо, если положительный и отрицательный, вы хотите независимую лабораторию, которая бы это верифицировала, повторяете это ещё раз и т.д.

— Как будет развиваться ситуация с эпидемией в России?

— Очевидно, что будет очень большой рост в ближайшие недели, а может быть, и месяцы. В Нью-Йорке сейчас больше 10 тысяч заболевших. Мы такие же, как Нью-Йорк. Почему должно быть по-другому? Вопрос идёт о порядковом росте. Если не заболевших, то людей с положительным диагнозом.

Мы, конечно, охраняемая Богом страна, но почему у нас должно быть 500, а в других местах десятки тысяч?

На самом-то деле вот здесь интересная научная часть и начинается. Если бы было широко организовано серологическое тестирование, вы могли бы оценить, сколько людей уже прошло через это. И именно вот по этой прослойке можно будет предсказывать, когда начнёт всё загибаться — когда новые случаи будут появляться с меньшей частотой, потому что просто вирусу негде будет больше жить.

— Вы говорите, если бы у нас было серологическое тестирование. А почему у нас его нет?

— Потому что, в отличие от теста с цепной полимеразной реакцией, которая позволяет вам такой плагин просто сделать — вы взяли другую нуклеотидную последовательность и используете её в стандартных наборах для детекции коронавируса, — тесты серологические, ИФА, иммунологические тесты требуют гораздо большей предварительной работы по получению антигена.

— Но они же есть по всему миру. Есть корейские тесты.

— Да, но их всё равно нужно произвести. Я, кстати, не знаю, насколько широко это всё делается. Первые появились в конце февраля, насколько я понимаю. Всё равно было существенное опоздание.

— Говорят, сейчас на каждой бензоколонке в Германии можно взять и себя протестировать.

— Не знаю. Мы же не можем теперь туда поехать, чтобы сказать, так это или нет. Если бы это было так, об этом точно рассказали бы.

— Мы действительно живём в ситуации, когда никто ничего не понимает.

— Да, я думаю, что так. И со всех сторон идёт различная информация. В конечном счёте всё равно всё станет относительно понятно, но задним числом. Мы почти ничего не можем предугадать.

— Но тем не менее вы же смотрите на то, что происходит во всём мире, видите какую-то определённую модель, которая развивается. Она развивается там, в Италии, вот таким образом. А в Китае эпидемия закончилась. Она почему закончилась?

— Расхожее утверждение, что были применены жёсткие карантинные меры, которые помогли по крайней мере остановить вспышку. Это не означает, что она не может начаться опять.

— Вы в это верите?

— Карантин должен работать, это правда. Это показывает любая математическая модель.

— Мог быть вирус сделан в лаборатории?

— Нет. В лаборатории так всё сложно делать. Все используют этот пример, что был сделан мозаичный вирус, когда был поменян рецептор, и показано было, что эпителиальные клетки могут в лаборатории заражаться.

— Была публикация, где было сказано, что действительно сделана попытка в лаборатории воспроизвести. Что было сделано?

— Ещё раньше, в 2002 году, была вспышка похожего вируса, назывался он SARS. Тоже есть геном и прочее. Вирус, который раньше на людях не практиковался, а теперь почему-то приобрёл такую способность. Хотя известно, что такие вирусы живут на этих несчастных мышах. А тот, кто на мышах живёт, обычно на человеке не живёт. И вы, сравнивая последовательности генов двух этих вирусов и понимая в целом, что способность заразить клетку связана с наличием на клетке рецепторов для вируса. У вируса есть какие-то шипики, они взаимодействуют с клеткой, после такого взаимодействия вирусно-генетический материал попадает внутрь клетки.

— Вирус должен эту клетку узнать?

— А они могут потом раз — и перелететь?

— Нет. Дело в том, что, если мы возьмём теперешний вирус, количество геномов которого сейчас уже зашкаливает, мы можем сравнить последовательность генома этого вируса с имеющимися в природе изолятами. Они не идентичные, но близки, и мы можем показать, что по всей длине генома вируса потихонечку накапливаются какие-то изменения относительно природных вариантов. Но это не было вставкой какого-то чужеродного материала — вот прямо посредине.

— То есть всегда вставку можно увидеть?

— Да, конечно. Потому что вставка имеет другую последовательность.

— Получается, сейчас нет ни одного искусственного вируса?

А здесь вы даже не знаете, что вам нужно сделать. Мы не можем объяснить, почему этот вирус такой. Посмотрев на мышиный вирус, или на верблюжий вирус, на MERS, или на этот конкретно, мы не можем объяснить, что произошло. Мы не понимаем, почему этот вирус вдруг раз — и перекинулся на человеческую популяцию. Они все родственные. Представьте себе, что некий длинный текст, который. если вы их начнёте сравнивать друг относительно друга, то в пределах 80%, может быть, даже 90% букв они будут совпадать. Но много букв, которые отличаются. В итоге у вас на геном в 30 тысяч различий будет, я не знаю, сотни. Почему и какое из этих различий ответственно за новое свойство, мы не знаем.