Что такое пцр генотипирование рнк вируса гепатита с методом пцр
Молекулярно-генетическое исследование для определения генотипа вируса гепатита С.
Применяемый набор реагентов может быть использован для диагностики вируса гепатита С и наиболее распространенных на территории России генотипов HCV (1a, 1b, 2, 3a и 4) in vitro.
Вирус гепатита С (ВГС).
Hepatitis C Virus (HCV) Genotyping, HCV Subtype.
Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Не курить в течение 30 минут до исследования.
Общая информация об исследовании
Вирус гепатита С (ВГС) способен поражать клетки печени, а также некоторые клетки крови (нейтрофилы, моноциты, В-лимфоциты). В основном инфекция передается через кровь (препараты для переливания элементов крови и плазмы, донорские органы, нестерильные шприцы, иглы, инструменты), реже вероятно заражение половым путем.
Острый вирусный гепатит, как правило, протекает бессимптомно и в большинстве случаев остается невыявленным. У 60-85 % инфицированных развивается хроническая инфекция, которая увеличивает риск развития цирроза, печеночной недостаточности и гепатоцеллюлярной карциномы. За свое скрытое, но разрушительное действие инфекция получила неофициальное название "ласковый убийца".
ВГС обладает наибольшей вариабельностью среди всех возбудителей вирусных гепатитов и благодаря высокой мутационной активности способен избегать воздействия защитных механизмов иммунной системы. Геномы вируса значительно отличаются в разных странах мира и имеют различную чувствительность к препаратам интерферонов.
Существует 6 основных генотипов вируса гепатита С и около 500 субтипов. Наиболее распространен в мире генотип 1 (40-80 %). 1а тип часто выявляется в США, 1b характерен для Западной Европы и Южной Азии. Генотип 2 встречается с частотой 10-40 %. Генотип 3 распространен в Шотландии, Австралии, Индии и Пакистане. ВГС 4 типа характерен для Средней Азии и Северной Африки, генотип 5 – для Южной Африки, 6 – для некоторых стран Азии. В России преобладает генотип 1b, далее с убывающей частотой - 3, 1a, 2, в США – 1a/1b, 2b, и 3a.
Противовирусная терапия, направленная на подавление прогрессирования заболевания, в редких случаях может ускорить развитие осложнений со стороны печени. Это происходит при неправильной оценке клинических и лабораторных показателей. Генотипирование РНК вируса гепатита С позволяет спрогнозировать эффект от планируемой терапии.
Генотип 1 хуже поддается лечению, чем генотипы 2 и 3. Кроме того, биопсию печени важнее провести именно при генотипе 1. Повышенные дозы препаратов интерферона рекомендованы для пациентов с 1-м и 4-м генотипами. Курс терапии у таких пациентов должен быть продлен до 48 недель даже при отсутствии вируса в крови более 24 недель. В случае успешности лечения, которая подтверждается снижением вирусной нагрузки крови ( Для чего используется исследование?
- Чтобы определить необходимость лечения и спрогнозировать течение заболевания.
- Для планирования длительности противовирусной терапии и дозировки лекарств.
- Для прогнозирования эффективности лечения.
- Для принятия решения о биопсии печени.
Когда назначается исследование?
- При обнаружении РНК вируса гепатита С и планировании противовирусной терапии.
Что означают результаты?
Референсные значения: РНК HCV не обнаружена.
При обнаружении указывается генотип:
Результат
Значение
Очень высокий риск хронизации инфекции и развития тяжелых осложнений. Необходимо лечение более высокими дозами интерферона в течение 48 недель.
В большинстве случаев в течение 24 недель достигается планируемый терапевтический эффект.
Труднее поддается лечению, требует доз препаратов, отличных от применяемых при терапии с генотипами 2 или 3.
Что может влиять на результат?
- Генотип вируса гепатита С иногда не выявляется при концентрации вируса в крови менее 1,25*10^3 МЕ/мл.
- Решение о длительности терапии, необходимой дозе препаратов и прекращении лечения может принять только лечащий врач на основании биохимических анализов функции печени, биопсии (при необходимости) и вирусной нагрузки.
- Существует вероятность повторного заражения вирусным гепатитом С другого генотипа из-за отсутствия перекрестного иммунного ответа и стойкого иммунитета.
ПЦР на гепатит С – обязательный анализ при обследовании пациента с симптомами поражения печени. Исследование назначают для подтверждения диагноза и получения максимально полной информации о возбудителе болезни, активности вирусной инфекции. Результаты служат основанием для назначения противовирусной терапии, определения ее продолжительности и оценки эффективности.
Диагностика с применением методики полимеразной цепной реакции получила распространение сравнительно недавно. Исследования на эту тему велись с середины 1970-х годов. Но первые публикации относительно возможности использования ПЦР в практической медицине появились только в середине 1980-х гг.
При объяснении, что такое ПЦР, врачи подчеркивают, что это самый надежный и достоверный анализ при гепатите С. Данный тест позволяет не только выявить частицы РНК вируса, но и установить его концентрацию (указывает на активность инфекционного процесса) и генотип. Полученные результаты играют ключевую роль для определения тактики и схемы дальнейшей терапии.
В чем состоит суть постановки реакции? При помощи определенных биологически активных веществ добиваются увеличения количество частиц РНК вируса в небольшом объеме крови. Впоследствии участки генома определяются разнообразными физико-химическими методами.
Постановка ПЦР осуществляется при помощи нескольких компонентов:
При некоторых способах постановки ПЦР дополнительно используются РНК-зонды и другие внутренние контроли, используемые в качестве контрольных образцов при выявлении результатов.
Сам процесс увеличения участков вирусной РНК при помощи матрицы именуют амплификацией. Реакция протекает в несколько этапов:
Перечисленные циклы постановки ПЦР повторяются несколько десятков раз, что обеспечивает многократное увеличение количества участков РНК возбудителя гепатита С уровня, определяемого лабораторными способами.
Перед проведением анализа образец забора крови соответствующим образом подготавливается. Содержащиеся РНК адсорбируются на буфере-носителе, затем смываются и используется для постановки полимеразной цепной реакции.
Детекция результатов проводится либо методом электрофореза (горизонтального или вертикального), либо способом гибридизации. Способ расшифровки результатов реакции выбирается исходя из целей проведения исследования (просто выявление РНК, либо определение ее ориентировочного количества).
ПЦР – самый точный анализ крови на гепатит С
Перечень предлагаемых исследований на HCV включает несколько пунктов, отличающихся по стоимости, срокам готовности и способу выполнения.
Если обратиться к протоколам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), порядок диагностики инфекции включает несколько последовательных этапов.
Для начала сдают:
- общий анализ крови и мочи;
- биохимия крови;
- исследование на содержание глюкозы (строго натощак);
- анализ на ВИЧ;
- флюорография;
- иммунограмма (при подозрении на наличие аутоиммунных патологий).
При отклонении показателей биохимического анализа крови от физиологической нормы пациенту назначают тест, основанный на обнаружении специфических антител, вырабатываемых при контакте вируса с кровью (ИФА).
Но подобный анализ крови на гепатит С имеет существенный недостаток. Процесс синтеза антител зависит от функционирования и выработки иммунокомпетентных клеток. Индивидуальные особенности организма могут стать причиной как ложноотрицательного, так и ложноположительного ответа.
Дальнейшая тактика действий зависит от того, что покажет исследование. В случае подтверждения диагноза, пациенту сразу же назначают гепатопротекторы, предупреждают о важности правильного питания и здорового образа жизни. Но таргетная терапия невозможна без определения уровня вирусной нагрузки и генотипа гепатита С.
Некоторые лекарственные препараты могут спровоцировать обострение гепатита В. Поэтому для исключения осложнений, дополнительно назначают анализы на HBsAg. HCV лечат только после получения отрицательного результата исследования.
Виды: качественный, количественный и генотипирование
При первичной диагностике гепатита С серологическим методом определяется титр вырабатываемых антител. Такой результат приблизительно показывает активность патологического процесса. Но максимально точную информацию доктор может получить только после изучения данных ПЦР.
В настоящее время практически во всех лабораториях анализ выполняют ультрачувствительным методом. Таким образом диагностика HCV возможно уже через 10–14 дней после заражения, реже – спустя 2,5–3 недели. В зависимости от целей, преследуемых в ходе исследования, доктор назначает конкретный тип теста.
Существуют следующие разновидности ПЦР:
- Качественный. При назначении диагностических тестов, у пациентов возникает вопрос, что показывает подобный метод исследования. Качественный анализ способом ПЦР – высокочувствительный тест, определяющий наличие РНК вируса в крови в минимальной концентрации. Обычно подобная разновидность полимеразной цепной реакции ставится по технологии обратной транскрипции. Это один из немногих способов ПЦР, в ходе которого в качестве мишени можно использовать РНК.
- Количественный. Количественный анализ на гепатит С позволяет определить точный уровень РНК HCV в крови. Проведение исследования возможно только одним способом – методом real-time. В ходе подготовки материала к постановке ПЦР в образец добавляют краситель. После каждого цикла амплификации проводится автоматизированное количественное исследование в режиме реального времени. Нередко методику проводят в сочетании с обратной транскрипцией. Таким образом возможно качественное определение малого количества копий РНК вируса. Устанавливать уровень РНК HCV количественно имеет смысл, если получен положительный результат качественной ПЦР.
- Генотипирование. Анализ сдается проводится на конечной стадии диагностического процесса. Принцип исследования построен на разнице в последовательности нуклеотидов, что отличает один генотип вируса гепатита С от другого. Обычно анализ делают методом мультипраймерной (мультиплексной) ПЦР.
При подозрении на носительство вируса, необходимо выполнить качественную ПЦР. Если результат отрицательный, человек скорее всего здоров. Но для полного исключения заражения рекомендуют повторить исследование через 7–10 дней. Если же РНК вируса обнаружена, проводят дальнейшие тесты (количественный и генотипирование).
Показания к проведению лабораторного теста
Основным показанием к сдаче крови на гепатит С методом полимеразной цепной реакции является положительный результат иммуноферментного анализа (вне зависимости от разновидности: Total, дифференцированный тест на IgG и IgM).
Кроме того, провериться нужно:
- в период беременности (тест делают дважды – в первом триместре и за 7–10 недель до родов);
- при работе, связанной с повышенным риском инфицирования (медсестры, лаборанты, работники донорских центров, косметологи и т.д.);
- при беспорядочных половых связях и незащищенном контакте с малознакомым человеком;
- на фоне ВИЧ, онкологических заболеваний, приема определенных медикаментозных средств и т.д.;
- пациентам, зависимым от внутривенных наркотиков;
- при постоянном проведении инвазивных диагностических или лечебных процедур;
- при проведенном до 1992 года переливании крови (ранее не существовало достоверных способов проверки донорского биологического материала на наличие вируса).
- при соприкосновении открытой раны с чужой кровью, нестерилизованным медицинским инструментарием.
Рост заболеваемости растет с каждым годом. Поэтому для раннего выявления инфекции лабораторные тесты на HCV рекомендуют сдавать один раз в год.
Где сдать анализ
При обращении в поликлинику, пациент имеет право на бесплатные анализы. Но сначала сдают тест ИФА. И только при положительном либо сомнительном результате показано исследование методом ПЦР. Поэтому провести срочную диагностику можно обратившись в платную лабораторию, где сдать кровь на ПЦР можно в удобное для пациента время. Одновременно рекомендуют сразу проверить показатели печеночных ферментов, стандартные клинические параметры крови.
Как правило, изучение крови методом ПЦР доступно практически в любой лаборатории. Если пункт забора крови не оснащен должным оборудованием, биологический материал транспортируют для проведения исследования с соблюдением температурного режима и других условий. Проведение ПЦР в поликлинике возможно только после других обследований, результаты которых косвенно укажут на наличие гепатита С.
Как правильно сдавать кровь
Перед тем, как сдавать кровь на обнаружения возможного вируса, следует соблюсти ряд правил подготовки к анализу.
Основные аспекты указаны в памятке:
- За 5–7 дней отказаться от потребления жирной, жареной пищи, алкоголя. В целом, доктора рекомендуют придерживаться правил питания по диете №5.
- За 12–14 часов до проведения исследования не есть. Пить можно только воду.
- Сдать кровь лучше в первой половине дня.
- До процедуры не курить.
Также следует предупредить доктора о принимаемых лекарственных препаратах, возможных проблемах со здоровьем, хронических заболеваниях.
Забор крови выполняется из вены. После окончания процедуры место прокола медсестра заклеивает стерильным пластырем, предупреждает о необходимости согнуть руку и держать ее в таком положении 10–15 минут. В противном случае высока вероятность появления болезненной гематомы.
Сколько по времени делается исследование?
Сколько делается анализ, зависит от лаборатории. Средний срок выполнения колеблется в пределах 1–3 дней. Некоторые клиники предоставляют платную услугу быстрой постановки ПЦР, однако время проведения ограничивается возможностями медицинской аппаратуры.
В поликлинике результаты могут передаваться врачу в течение 7–10 дней. Это связывают с большим наплывом пациентов. При этом биологический материал хранится в соответствии со всеми требованиями.
Расшифровка результатов
Как правило, расшифровка качественной ПЦР не представляет сложности. Но во избежание ошибочной трактовки, с полученным из лаборатории бланком следует обратиться к врачу. Варианты, что означает та или иная разновидность ПЦР, приведены в таблице.
Вид исследования | Возможный результат и предполагаемая расшифровка |
Качественная ПЦР | |
Количественная | |
Генотипирование | |
Генотипирование | Проводится, если обнаружено присутствие вируса в организме. В бланке показывают выявленный подтип HCV |
Расшифровкой результатов должен заниматься квалифицированный специалист. Так, иногда возникают ситуации, когда ИФА на гепатит С положительный, а ПЦР отрицательный. Подобное расхождение объясняют несколькими причинами. Это может быть ошибкой лаборатории, поэтому одно из исследований необходимо повторить спустя 2–3 недели.
Иногда такие результаты возникают вследствие скрыто перенесенной острой HCV-инфекции. ИФА определяет наличие антител, но по факту, РНК вируса в организме или отсутствует, или не выявляется из-за ничтожно малой концентрации. В любом случае пациент с подобными данными исследований нуждается в дальнейшем наблюдении и консультациях врача.
Качественный анализ ПЦР является относительно быстрым и наиболее точным методом первичной диагностики гепатита С. По результатам исследования можно определить, заражен человек или нет, а затем проводить более детальные лабораторные методы. Ложноотрицательный результат вероятен в первые 14–21 день после заражения, когда количества РНК вируса недостаточно, для выявления даже высокочувствительными тест-системами.
Ложноположительный результат возможен по вине сотрудников лаборатории. Иногда такие данные получают при беременности, активном течении онкологических и/или аутоиммунных заболеваний.
Чтобы исключить вероятность неправильной расшифровки, качественный анализ рекомендуют повторить через 3–4 недели.
Количественный анализ методом ПЦР на гепатит С обычно назначают для определения вирусемии в ходе противовирусной терапии. В норме, по мере приема лекарственных средств вирусологическая нагрузка постепенно снижается. Цель лечения – отрицательные или минимально допустимые показатели исследования.
Расшифровка результатов зависит от единиц измерения, используемых в лаборатории, поэтому обычно в бланке указывают полученные данные, референсные значения и описание отклонений от нормы.
Количественный анализ ПЦР необходим для оценки эффективности лечения, подбора схемы терапии (сочетание нескольких противовирусных препаратов), определения продолжительности приема медикаментов. Исследование периодически проводится и после окончания курса лечения для своевременного выявления рецидива.
Одно из основных исследований, которые проводятся на этапе диагностики и обязательно до начала терапии, так как генотип – главный фактор, влияющий на подбор лекарственных средств.
К настоящему моменту известно об 6 генотипах HCV (каждый имеет свои подтипы), но в России и странах Европы у подавляющего числа больных выявляют:
Остальные генотипы диагностируют реже. В отличие от количественного анализа, генотипирование выполняют один раз и не повторяют в процессе лечения (исключение составляют устойчивые формы HCV, не поддающиеся терапии.
Преимущества ПЦР диагностики
- высокая точность;
- возможность первичной диагностики;
- оценка эффективности лечения по определению вирусологической нагрузки;
- точное установление генотипа вируса, что предопределяет тактику дальнейшего лечения;
- доступная стоимость.
Пункты забора крови для проведения исследования есть в любом городе, что дополнительно облегчает диагностику и делает сдачу анализов доступными для каждого пациента.
Сколько стоит анализ
Стоимость анализа ПЦР на гепатит С зависит от ряда факторов:
- Ценовая политика лабораторного центра и его местонахождение (так, в Москве подобные услуги обходятся дороже).
- Разновидность исследования (цена на качественный, количественный анализ и генотипирование отличается).
- Сроки выполнения (ряд лабораторий предлагают доплатить определенную сумму за срочное получение результатов).
Узнать, сколько стоит ПЦР на гепатит С можно либо по телефону, либо на интернет-сайте лаборатории.
Средняя цена по России составляет:
- качественное определение РНК вируса – 700–1000 рублей и до 3000 рублей с использованием ультрачувствительных тест-систем;
- генотипирование – 1000–1200 рублей (в комплексе с количественным определением – до 4000 рублей);
- количественное определение вирусологической нагрузки – 2300–3000 рублей.
В поликлинике по месту жительства подобные исследования проводят бесплатно (при наличии полиса ОМС). Но лаборанту обязательно предъявляют направление от лечащего врача.
Читайте также: