Реалбест рнк вич количественный инструкция
Новый набор реагентов для выявления ДНК вируса герпеса человека 8 типа методом ПЦР в режиме реального времени РеалБест ДНК ВГЧ-8 more
Получена СЕ марка на ПЦР-наборы для диагностики ИППП, респираторных инфекций, кандидоза, ВПЧ-инфекции. more
ID] => 2406 [TIMESTAMP_X] => 18.06.2019 09:49:15 [
TIMESTAMP_X] => 18.06.2019 09:49:15 [MODIFIED_BY] => 9321 [
MODIFIED_BY] => 9321 [DATE_CREATE] => 18.06.2019 09:49:15 [
DATE_CREATE] => 18.06.2019 09:49:15 [CREATED_BY] => 9321 [
CREATED_BY] => 9321 [IBLOCK_ID] => 17 [
IBLOCK_ID] => 17 [IBLOCK_SECTION_ID] => 2403 [
IBLOCK_SECTION_ID] => 2403 [ACTIVE] => Y [
ACTIVE] => Y [GLOBAL_ACTIVE] => Y [
GLOBAL_ACTIVE] => Y [SORT] => 9100 [
SORT] => 9100 [NAME] => ВИЧ-инфекция [
NAME] => ВИЧ-инфекция [PICTURE] => [
PICTURE] => [LEFT_MARGIN] => 202 [
LEFT_MARGIN] => 202 [RIGHT_MARGIN] => 203 [
RIGHT_MARGIN] => 203 [DEPTH_LEVEL] => 2 [
DEPTH_LEVEL] => 2 [DESCRIPTION] => [
DESCRIPTION] => [DESCRIPTION_TYPE] => text [
DESCRIPTION_TYPE] => text [SEARCHABLE_CONTENT] => ВИЧ-ИНФЕКЦИЯ [
SEARCHABLE_CONTENT] => ВИЧ-ИНФЕКЦИЯ [CODE] => [
SOCNET_GROUP_ID] => [LIST_PAGE_URL] => /prod/index.php [
LIST_PAGE_URL] => /prod/index.php [SECTION_PAGE_URL] => /prod/index.php?SECTION_ID=2406 [
SECTION_PAGE_URL] => /prod/index.php?SECTION_ID=2406 [IBLOCK_TYPE_ID] => products [
IBLOCK_TYPE_ID] => products [IBLOCK_CODE] => catalog [
IBLOCK_CODE] => catalog [IBLOCK_EXTERNAL_ID] => [
EXTERNAL_ID] => [IPROPERTY_VALUES] => Array ( ) [PATH] => Array ( [0] => Array ( [ID] => 2403 [
ID] => 2403 [CODE] => root_pcr [
CODE] => root_pcr [XML_ID] => [
EXTERNAL_ID] => [IBLOCK_ID] => 17 [
IBLOCK_ID] => 17 [IBLOCK_SECTION_ID] => [
IBLOCK_SECTION_ID] => [SORT] => 8800 [
SORT] => 8800 [NAME] => ПЦР диагностика [
NAME] => ПЦР диагностика [ACTIVE] => Y [
ACTIVE] => Y [DEPTH_LEVEL] => 1 [
DEPTH_LEVEL] => 1 [SECTION_PAGE_URL] => /prod/index.php?SECTION_ID=2403 [
SECTION_PAGE_URL] => /prod/index.php?SECTION_ID=2403 [IBLOCK_TYPE_ID] => products [
IBLOCK_TYPE_ID] => products [IBLOCK_CODE] => catalog [
IBLOCK_CODE] => catalog [IBLOCK_EXTERNAL_ID] => [
IBLOCK_EXTERNAL_ID] => [GLOBAL_ACTIVE] => Y [
GLOBAL_ACTIVE] => Y [IPROPERTY_VALUES] => Array ( ) ) [1] => Array ( [ID] => 2406 [
EXTERNAL_ID] => [IBLOCK_ID] => 17 [
IBLOCK_ID] => 17 [IBLOCK_SECTION_ID] => 2403 [
IBLOCK_SECTION_ID] => 2403 [SORT] => 9100 [
SORT] => 9100 [NAME] => ВИЧ-инфекция [
NAME] => ВИЧ-инфекция [ACTIVE] => Y [
ACTIVE] => Y [DEPTH_LEVEL] => 2 [
DEPTH_LEVEL] => 2 [SECTION_PAGE_URL] => /prod/index.php?SECTION_ID=2406 [
SECTION_PAGE_URL] => /prod/index.php?SECTION_ID=2406 [IBLOCK_TYPE_ID] => products [
IBLOCK_TYPE_ID] => products [IBLOCK_CODE] => catalog [
IBLOCK_CODE] => catalog [IBLOCK_EXTERNAL_ID] => [
IBLOCK_EXTERNAL_ID] => [GLOBAL_ACTIVE] => Y [
GLOBAL_ACTIVE] => Y [IPROPERTY_VALUES] => Array ( ) ) ) ) [SECTIONS_COUNT] => 0 )
№ по каталогу | Наименование и краткое описание | Количество определений | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
D-0186 |
РеалБест ДНК ВИЧ (ЦК) | 48 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D-0187 | 48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D-0198 | 48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D-0197 | 48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D-0199 | 48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D-0195 | 96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D-0196 |
Субтипы | До 1996 г. | 2001 г. |
---|---|---|
A | 11 | 93 |
B | 42 | 2 |
C | 7 | |
D | 3 | |
F | ||
G | 36 | |
H | ||
CRF04 AB | 4 | |
CRF01 АЕ | ||
CRF02 АG |
Материалы и методы
Субтипы | Количество |
---|---|
A | 6 |
B | 5 |
C | 8 |
D | 6 |
F | 6 |
G | 3 |
CRF01_AE | 5 |
CRF01_AG | 7 |
Mosaic (URF) | 4 |
Забор крови и подготовка ее к анализу. Кровь забирали утром натощак в пробирку ЭДТА из расчета 1:20. В течение 6 часов с момента забора крови отбирали плазму. Для этого цельную кровь центрифугировали при в течение 20 минут. Хранили образцы плазмы при температуре минус 700С.
Определение концентрации РНК ВИЧ. Концентрацию РНК ВИЧ определяли согласно прилагаемым инструкциям. Заявленные характеристики и процедура анализов были следующими:
Результаты
Разница логарифмов концентрации РНК ВИЧ (LCx Cobas Amplicor) | Количество образцов/% |
---|---|
от 0,51 до 1 lg | 3/1,3 |
В пределах 0,5 lg | 209/87,1 |
28/11,7 |
Высокая степень совпадения результатов была выявлена при тестировании образцов плазмы крови от Российских пациентов. Частота дискордантных результатов составляла 10,6%.
Субтипы ВИЧ, представленные в панели | Разница логарифмов концентрации РНК ВИЧ |
---|---|
D | 0,18 |
D | 0,11 |
D | 0,34 |
D | 0,31 |
D | 0,34 |
D | 0,14 |
G | 0,16 |
G | 0,66 |
G | 0,82 |
F | 0,32 |
F | 0,30 |
F | 0,08 |
F | 0,00 |
F | 0,51 |
F2 | 0,28 |
A | 0,52 |
A | 0,16 |
A | 0,75 |
A | 0,54 |
A | 0,33 |
A | 0,22 |
CRF01_AE | 0,22 |
CRF01_AE | 0,25 |
CRF01_AE | 0,39 |
CRF01_AE | 0,65 |
CRF01_AE | 0,11 |
CRF02_AG | 0,19 |
CRF02_AG | 0,25 |
CRF02_AG | 0,45 |
C | 0,35 |
C | 0,64 |
C | 0,05 |
C | 0,83 |
C | > 0,63 |
C | 0,53 |
C | 0,42 |
C | 0,09 |
B | 0,06 |
B | 0,20 |
B | 0,04 |
B | 0,08 |
B | 0,01 |
Mosaic | 0,46 |
Mosaic | 0,63 |
Mosaic | 0,28 |
Mosaic | 0,38 |
Обсуждение
В настоящей работе было проведено исследование 207 образцов плазмы крови пациентов, проживающих в разных регионах России, а также панель образцов с ранее охарактеризованными субтипами которые были получены пациентов из разных стран мира.
Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Прасолова Мария Анатольевна, Иванов Михаил Константинович, Гашникова Наталья Матвеевна, Нетёсова Екатерина Сергеевна, Дымшиц Григорий Моисеевич
На основе метода ОТ-ПЦР с флюоресцентной детекцией в режиме реального времени разработан прототип диагностического набора, позволяющий надежно выявлять в сыворотке и плазме крови различные генетические варианты РНК ВИЧ-1 групп M,N,O,P и РНК ВИЧ-2 . Набор обладает высокой устойчивостью к нуклеотидным несоответствиям , широким линейным диапазоном измерения концентраций РНК ВИЧ, 100% аналитической специфичностью и хорошей аналитической чувствительностью: 42 МЕ/мл (ВИЧ-1 группы М), 45 копий/мл ( ВИЧ-2 ), 92 копий/ мл ( ВИЧ-1 группы O ), 90 копий/мл (ВИЧ-1 группы N). С помощью разработанного диагностического набора удалось успешно выявить и определить концентрацию РНК ВИЧ для всех образцов из международной референсной панели генотипов ВИЧ-1; результаты проведенных тестов коррелируют с данными, полученными с помощью коммерческих тестов.
Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Прасолова Мария Анатольевна, Иванов Михаил Константинович, Гашникова Наталья Матвеевна, Нетёсова Екатерина Сергеевна, Дымшиц Григорий Моисеевич
A Single-Tube Real-Time RT-PCR Assay for the RNA Detection and Quantification of Genetically Diverse HIV Including Rare Non-M Group of the HIV-1 and HIV-2
The RT-PCR method with real-time fluorescence detection was used for development of prototype of diagnostic kit for reliable diagnosis of genetic variants of RNA of the HIV-1of groups M, N, O, P and RNA of the HIV-2 in blood plasma and serum. The kit is stable against nucleotide defects, provides broad linear range of concentration of the HIV RNA, 100% analytical specificity and adequate analytical sensitivity: 42 МЕ/ml ( HIV-1 of group M), 45 copies/ml ( HIV-2 ), 92 copies/ml (HIV -1 of group O ), 90 copies/ml ( HIV-1 of group N). The kit provided successful detection and measurement of HIV RNA concentration in the samples of the international reference panel of the HIV-1 genotype. The results of the test correlate with results of commercial tests.
Прасолова М.А.1'2'3, Иванов М.К.1'2 3, Гашникова Н.М.4, Нетёсова Е.С.2, Дымшиц Г.М.5
ОДНОПРОБИРОЧНЫЙ ТЕСТ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ И КОЛИЧЕСТВЕННОГО АНАЛИЭА РНК ГЕНЕТИЧЕСКИХ РАЭНОВИДНОСТЕЙ ВИЧ, ВКЛЮЧАЯ РЕДКИЕ НЕ-М ГРУППЫ ВИЧ-1 И ВИЧ-2, НА ОСНОВЕ ОТ-ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ
фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск.
На основе метода ОТ-ПЦР с флюоресцентной детекцией в режиме реального времени разработан прототип диагностического набора, позволяющий надежно выявлять в сыворотке и плазме крови различные генетические варианты РНК ВИЧ-1 групп М,К,0,Р и РНК ВИЧ-2. Набор обладает высокой устойчивостью к нуклеотидным несоответствиям, широким линейным диапазоном измерения концентраций РНК ВИЧ, 100% аналитической специфичностью и хорошей аналитической чувствительностью: 42 МЕ/мл (ВИЧ-1 группы М), 45 копий/мл (ВИЧ-2), 92 копий/ мл (ВИЧ-1 группы 0), 90 копий/мл (ВИЧ-1 группы К). С помощью разработанного диагностического набора удалось успешно выявить и определить концентрацию РНК ВИЧ для всех образцов из международной референсной панели генотипов ВИЧ-1; результаты проведенных тестов коррелируют с данными, полученными с помощью коммерческих тестов. Ключевые слова: ВИЧ-1 группа O; ВИЧ-2; устойчивость к нуклеотидным несоответствиям; ОТ-ПЦР.
Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) продолжает оставаться одной из глобальных проблем здравоохранения: в мире количество людей, инфицированных ВИЧ-1, составляет 34 млн, в России - более 730 тыс. и продолжает расти [1]. Эффективность предотвращения дальнейшего распространения ВИЧ, как и лечения уже заразившихся, значительно зависит от точной, высокочувствительной и своевременной диагностики инфекции, в том числе выявления РНК ВИЧ с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) [2]. Тестирование препаратов донорской крови на РНК ВИЧ является обязательным во многих странах, в том числе и в России.
Особую проблему для диагностики ВИЧ-инфекции создает высокая генетическая изменчивость вируса. Выделены 4 генетические группы ВИЧ-1 (М, К, О и недавно описанная группа Р) [3]. Основной вклад в мировую эпидемию СПИДа вносят штаммы ВИЧ-1 группы М, которая в свою очередь делится на 9 субтипов и множество рекомбинантных форм [4]. Группы вирусов К, О и Р считаются редкими за пределами Африки, и в России пока официально не зарегистрировано ни одного случая заражения штаммами этих групп. Тем не менее уже описано много случаев инфицирования ВИЧ-1 группы О в разных странах Европы и США [5, 6]. Очевидно, что распространение редких групп N и Р также возможно. Ни один из отечественных и далеко не все импортные коммерческие тесты способны выявлять штаммы ВИЧ-1 не-М групп (причем эта проблема касается не только ПЦР, но и серологических методов [7]), что создает риск распространения таких недоступных для диагностики, но от этого не менее патогенных геновариантов вируса.
ВИЧ-2 также состоит из нескольких генетически удаленных друг от друга субтипов и их рекомбинан-
тов [8, 9]. Наиболее распространенными являются субтипы А и В. ВИЧ-2 встречается во всех частях света, хотя общее число инфицированных ВИЧ-2 гораздо ниже, чем ВИЧ-1. В силу генетической удаленности от ВИЧ-1 многие антиретровирусные препараты, в частности ненуклеозидные ингибиторы ревертазы, не эффективны при лечении пациентов с ВИЧ-2 [10]. Большинство современных серологических тестов выявляют антитела к вирусам обоих типов, однако к ПЦР-тестам такие требования до недавнего времени не предъявлялись, большинство коммерчески доступных диагностических наборов оптимизировано только для выявления РНК ВИЧ-1. Показано, что, как и в случае ВИЧ-1, вирусная нагрузка ВИЧ-2 в плазме крови коррелирует со стадией развития заболевания и ее измерение может использоваться в прогностических целях для мониторинга состояния пациента и назначения терапии [11]. Следовательно, определение РНК ВИЧ-2 актуально не только в качественном, но и в количественном варианте. Таким образом, существует объективная потребность в создании удобных для применения в клинических лабораториях доступных по цене высокочувствительных тестов для выявления и достоверной количественной оценки РНК ВИЧ-1 и ВИЧ-2, охватывающих все генетические группы и субтипы вируса.
Целью данной работы являлась разработка на основе метода ПЦР в реальном времени высокочувствительного теста для выявления РНК всех генетических групп ВИЧ-1 и ВИЧ-2 в одной пробирке.
Материалы и методы
Биологический материал. Клинические образцы сыворотки или плазмы крови, содержащие РНК ВИЧ-1 группы М, а также образцы сыворотки крови здоровых доноров были предоставлены Новосибирским областным центром по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, лабораторией клинической иммунологии НИИ скорой помощи им. Н.В. Склифосовского г. Москвы.
Для определения предела чувствительности и границ динамического диапазона измерений концентраций использовали положительный контрольный образец (ПКО) РНК ВИЧ-1 субтипа А, охарактеризованный относительно международного стандарта РНК ВИЧ-1, полученной из Национального института биологических стандартов и контроля (NIBSC). Приготовление ПКО РНК ВИЧ-1 описано ранее [12].
Получение клинических образцов от пациентов, инфицированных ВИЧ-2 и ВИЧ-1 групп К,0,Р, было затруднительно из-за крайне малой распространенности этих вирусов в России. Основные этапы оптимизации теста проводили на искусственно синтезированных ДНК и РНК, соответствующих по нуклеотид-ным последовательностям имеющимся в базе данных фрагментам генома изолятов ВИЧ-1 групп О (8 геновариантов), групп N (2 геноварианта), группы Р, редких субтипов группы М (26 геновариантов) и ВИЧ-2 (субтипы А и В). Сборку двухцепочечных
Также в работе использовали лизат штамма ROD ВИЧ-2, полученный после культивирования вируса на чувствительных клетках. Путем секвенирования участка LTR размером 391 ну-клеотид и последующего филогенетического анализа подтвердили принадлежность данного образца к субтипу А. На основе лизата ВИЧ-2 был изготовлен ПКО РНК ВИЧ-2. Данный образец был разведен в пуле донорских сывороток, не содержащих маркеров ВИЧ, вирусных гепатитов В и С, разделен на аликвоты и лиофильно высушен. Концентрацию РНК ВИЧ-2 ПКО определяли посредством ПЦР-анализа с помощью разработанного теста, для построения калибровочной кривой использовали описанный выше количественный стандарт ВИЧ-2.
Нуклеотидные последовательности праймеров для амплификации участка ЬТК ВИЧ-1 групп Ш,0,Р и результаты их проверки на предмет устойчивости к мисматчам
- ПЦР на РНК ВИЧ (Amplicor HIV-1 Monitor Test 1.5, фирма-изготовитель Roche; 800-526-1247)
- Метод разветвленной ДНК (Versant HIV-1 RNA 3.0 Assay, фирма- изготовитель Bayer; 800-434-2447)
- Изотермальная реакция амплификации последовательностей нуклеиновых кислот (NASBA) (NucliSens HIV-1 QT, фирма- изготовитель bioMerieux, 800-682-2666)
Как показано в таблице 2.4, у каждой тест-системы свой порог и диапазон чувствительности (J Clin Microbiol 1996; 34:3016; J Med Virol 1996; 50:293; J Clin Microbiol 1996; 34:1058; J Clin Microbiol 1998; 36:3392). Два стандартных отклонения (95% доверительный интервал) для результатов тестов составляют 0,3–0,5 log10 (т. е. результаты могут отличаться в 2–3 раза) (J Infect Dis 1997; 175:247; AIDS 1999; 13:2269). Это значит, что 95% доверительный интервал для значения 10 000 копий/мл составляет от 3 100 до 32 000 копий/мл. Значения вирусной нагрузки, полученные при использовании тест-системы Amplicor 1.5 (Roche) и методом рДНК (Versant 3.0), близки, за исключением нижнего участка линейного диапазона (
При определении вирусной нагрузки не-В-подтипов ВИЧ наблюдается значительно больший разброс показателей. Метод разветвленной ДНК (Versant 3.0) несколько превосходил остальные методики в отношении определения вирусной нагрузки ВИЧ подтипов A–D, F, G, CRF01_AE и CRF01_AG (межподтиповых рекомбинантных форм) и O; при использовании этого метода 83% результатов различались не более чем на 0,5 log10. При использовании Amplicor Monitor 1.5 этот показатель был 74%, а для NucliSens — 61% (J Clin Microbiol 2005; 43:3860). Результаты других исследований подтверждают эти данные (J Med Virol 2006; 78:883; J Acquir Immune Defic Syndr 2002; 29:330).
Таблица 2.4. Тесты на ВИЧ-1
Метаанализ 12 публикаций выявил наличие умеренных различий уровня вирусной нагрузки у мужчин и женщин: оказалось, что вирусная нагрузка у женщин в среднем на 0,23 log10 /мл (? в 2 раза) ниже, чем у мужчин (J Acquir Immune Defic Syndr 2002; 31:11). Однако эти различия исчезают при количестве лимфоцитов CD4 -1 и поэтому практически не влияют на решения относительно лечения (J Acquir Immune Defic Syndr 2000; 24:218; J Infect Dis 1999; 180:666; Clin Infect Dis 2002; 35:313; Lancet 1998; 352:1510; N Engl J Med 2001; 344:720).
Количественный метод определения РНК ВИЧ используется для диагностики острой ВИЧ-инфекции, прогноза вероятности передачи вируса, прогноза темпа прогрессирования ВИЧ-инфекции, выявления показаний к началу антиретровирусной терапии, а также для наблюдения за эффективностью лечения (Ann Intern Med 1995; 122:573; N Engl J Med 1996; 334:426; J Infect Dis 1997; 175:247; J Infect Dis 2002; 185:905).
Приведены из клинических стандартов Американского отделения Международного общества борьбы со СПИДом (IAS-USA) (JAMA 2006; 296:827) и Министерства здравоохранения и социальных служб США (DHHS) (www.aidsinfo.nih.gov/guidelines).
- Гарантия качества. Вирусную нагрузку рекомендуется измерять на фоне стабильного клинического состояния, не ранее чем через 4 недели после вакцинации или перенесенной инфекции, всегда одним и тем же методом в одной и той же лаборатории.
- Частота лабораторных обследований при наблюдении за эффективностью терапии. После двукратного измерения исходного уровня вирусной нагрузки контрольные измерения следует проводить регулярно, каждые 3–4 месяца (Clin Infect Dis 2001; 33:1060). В начале лечения и после его коррекции вирусную нагрузку измеряют через 1–4 недели (альфа-спад), затем через 12–16 недель и 16–24 недели. Об эффективности лечения свидетельствует снижение вирусной нагрузки на 0,75–1,0 log10 копий/мл от исходной через 1 неделю (Lancet 2001; 358:1760; J Acquir Immune Defic Syndr 2002; 30:167), снижение на 1,5–2 log10 копий/мл (до Интерпретация результатов. Значимыми считаются изменения уровня РНК ВИЧ на ?50% (на 0,3 log10 копий/мл).
- На основании уровня вирусной нагрузки в крови нельзя судить о степени повреждения функции иммунной системы, способности популяции лимфоцитов CD4 к восстановлению, чувствительности вируса к антиретровирусным препаратам, вирулентных свойствах вируса, его способности к репликации и к образованию синцития из инфицированных клеток, а также о вирусной нагрузке в других тканях (например, в лимфатических узлах, в ЦНС, в ЖКТ, в выделениях из половых путей).
- Факторы, повышающие вирусную нагрузку:
- смена доминирующего штамма ВИЧ, когда вирус, не способный образовывать синцитий (использующий в качестве корецептора хемокиновый рецептор CCR5), вытесняется вирусом, способным образовывать синцитий (использующим в качестве корецептора хемокиновый рецептор CXCR4);
- прогрессирование ВИЧ-инфекции;
- неудача антиретровирусного лечения из-за недостаточной противовирусной активности препаратов, недостаточных концентраций препаратов в организме, несоблюдения режима лечения и резистентности вируса;
- суперинфекция ВИЧ (J Infect Dis 2005; 192:438);
- острые инфекционные заболевания: на фоне активной формы туберкулеза вирусная нагрузка повышается в 5–160 раз (J Immunol 1996; 157:1271); на фоне пневмококковой пневмонии вирусная нагрузка повышается в 3–5 раз;
- прививки, в том числе введение противогриппозной вакцины и вакцины Pneumovax (против Streptococcus pneumoniae) (Blood 1995; 86:1082; N Engl J Med 1996; 335:817; N Engl J Med 1996; 334:1222). В этом случае повышение вирусной нагрузки небольшое и сохраняется от 2 до 4 недель.
- Относительные преимущества различных тест-систем. У тестсистемы Versant 3.0 хорошая воспроизводимость результатов для вирусных нагрузок в диапазоне 75–500 000 копий/мл. Линейный диапазон для суперчувствительной тест-системы Amplicor составляет 50– 100 000 копий/мл. Эту тест-систему не следует использовать при обследовании пациентов, у которых ожидается более высокая вирусная нагрузка (J Clin Microbiol 2000; 38:2837). У метода NucliSens более широкий динамический диапазон (176–3 500 000 копий/мл), и его можно использовать для измерения количества вируса как в крови, так и в других биологических жидкостях и тканях, например, в семенной жидкости, спинномозговой жидкости, грудном молоке, слюне и вагинальных выделениях (J Clin Microbiol 2000; 38:1414).
Таблица 2.5. Сравнительная характеристика лицензированных FDA тест-систем, основанных на разных методах измерения вирусной нагрузки
Roche | Bayer | bioMerieux | |
---|---|---|---|
Контактный телефон | 800-526-1247 | 800-434-2447 | 800-682-2666 |
Торговое название | Amplicor HIV Monitor 1.5 | Versant HIV-1 RNA 3.0 | NucliSens HIV-1 QT |
Техника | ОТ-ПЦР | рДНК | NASBA |
Сравнение результатов | Результаты, получаемые методом ОТ-ПЦР, сопоставимы с результатами, получаемыми методом рДНК (Versant) с использованием тест-систем 2.0 и 3.0 | Результаты, получаемые методом рДНК, сопоставимы с результатами, получаемыми методом ОТ-ПЦР (Amplicor) | Результаты, по-видимому, сопоставимы с результатами, получаемыми методами ОТ-ПЦР и рДНК, но пока не получено достаточно данных |
Преимущества и недостатки | Меньше ложноположительных результатов у ВИЧ-отрицательных пациентов по сравнению с методом рДНК | Выполнение исследования занимает меньше времени у лаборанта. Хороший динамический диапазон, но выше порог определения вирусной нагрузки | Может применяться для обнаружения вируса в тканях и биологических жидкостях, например, выделениях половых путей. Самый большой динамический диапазон. |
Динамический диапазон | Стандартный (Amplicor 1.5): 400–750 000 копий/мл Суперчувствительный (Ultra-Direct 1.5): 50–100 000 копий/мл | рДНК 3.0: 75–500 000 копий/мл* | NucliSens HIV-1 QT: 176–3 500 000 копий/мл; динамический диапазон зависит от объема |
Подтип вируса | Тест-система 1.5: от A до G | от A до G | от A до G |
Необходимый объем материала для исследования | Amplicor: 0,2 мл Суперчувствительный: 0,5 мл | 1 мл | От 10 мкл до 2 мл |
Пробирки | ЭДТА (пробирка с сиреневой крышкой) | ЭДТА (пробирка с сиреневой крышкой) | ЭДТА, гепарин, цельная кровь, любая биологическая жидкость, МКПК, семенная жидкость, ткани и т. д. |
Требования | Отделить плазму не позже чем через 6 часов после забора крови, перед транспортировкой заморозить при температуре –20°С или –70°С. | Отделить плазму не позже чем через 4 часа после забора крови, перед транспортировкой заморозить при температуре –20°С или –70°С. | Отделить сыворотку или плазму не позже чем через 4 часа после забора крови, перед транспортировкой заморозить при температуре –20°С или –70°С. |
* Нижнее пороговое значение вирусной нагрузки, установленное FDA, составляет 75 копий/мл. За пределами США нижнее пороговое значение вирусной нагрузки составляет 50 копий/мл.
Поделиться |
Закон закупки 44-ФЗЗакон, регулирующий правовые отношения в области государственных закупок.
ЗаказчикИНН: 1701009973 / КПП: 170101001
Информационная лентаПри прокрутке вниз Вы можете получить очень полезную информацию, подобранную специально для Вас нашей программой. А также самые интересные и актуальные статьи о тендерах и закупках, которые мы подобрали для Вас на просторах интернета.
|
Портал отображает информацию о закупках, публикуемых в сети интернет
и находящихся в открытом доступе, и предназначен для юрлиц и индивидуальных предпринимателей,
являющихся участниками размещения государственного и коммерческого заказа. Сайт использует Cookie, которые нужны для авторизации пользователя.
На сайте стоят счетчики Яндекс.Метрика, Google Analytics и LiveInternet,
которые нужны для статистики посещения ресурса.
Читайте также:
- Вич инфекция у детей питания
- Если вич с конца капает или нет
- Почему нельзя принимать линекс при вич
- Вич спид вместе мы
- Вич что такое кресты